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5. 乙醛酸循环：一种被修改的柠檬酸循环，在其异柠檬酸和苹果酸之间反应顺序有改变，以及乙酸是用作能量和中间物的一个来源。某些植物和微生物体内有此循环，他需要二分子乙酰辅酶A的参与；并导致一分子琥珀酸的合成。

6. 柠檬酸穿梭：就是线粒体内的乙酰CoA 与草酰乙酸缩合成柠檬酸，然后经内膜上的三羧酸载体运至胞液中，在柠檬酸裂解酶催化下，需消耗ATP 将柠檬酸裂解回草酰乙酸和，后者就可用于脂肪酸合成，而草酰乙酸经还原后再氧化脱羧成丙酮酸，丙酮酸经内膜载体运回线粒体，在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸，这样就可又一次参与转运乙酰CoA 的循环。

7．乙酰CoA 羧化酶系：大肠杆菌乙酰CoA 羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白（BCCP）和转羧基酶三种组份，它们共同作用催化乙酰CoA 的羧化反应，生成丙二酸单酰-CoA。

8．脂肪酸合酶系统：脂肪酸合酶系统包括酰基载体蛋白（ACP）和6 种酶，它们分别是：乙酰转酰酶；丙二酸单酰转酰酶；β-酮脂酰ACP 合成酶；β-酮脂酰ACP 还原酶；β-羟；脂酰ACP 脱水酶；烯脂酰ACP 还原酶。

第八章 含氮化合物代谢

1．蛋白酶：以称肽链内切酶（Endopeptidase），作用于多肽链内部的肽键，生成较原来含氨基酸数少的肽段，不同来源的蛋白酶水解专一性不同。

2．肽酶：只作用于多肽链的末端，根据专一性不同，可在多肽的N-端或C-端水解下氨基酸，如氨肽酶、羧肽酶、二肽酶等。

3．氮平衡：正常人摄入的氮与排出氮达到平衡时的状态，反应正常人的蛋白质代谢情况。

4．生物固氮：利用微生物中固氮酶的作用，在常温常压条件下将大气中的氮还原为氨的过程（N2 + 3H2→ 2 NH3）。 5．硝酸还原作用：在硝酸还原酶和亚硝酸还原酶的催化下，将硝态氮转变成氨态氮的过程，植物体内硝酸还原作用主要在叶和根进行。

6．氨的同化：由生物固氮和硝酸还原作用产生的氨，进入生物体后被转变为含氮有机化合物的过程。 7．转氨作用：在转氨酶的作用下，把一种氨基酸上的氨基转移到α-酮酸上，形成另一种氨基酸。

8．尿素循环：尿素循环也称鸟氨酸循环，是将含氮化合物分解产生的氨转变成尿素的过程，有解除氨毒害的作用。 9．生糖氨基酸：在分解过程中能转变成丙酮酸、α-酮戊二酸乙、琥珀酰辅酶A、延胡索酸和草酰乙酸的氨基酸称为生糖氨基酸。

10．生酮氨基酸：在分解过程中能转变成乙酰辅酶A 和乙酰乙酰辅酶A 的氨基酸称为生酮氨基酸。

11．核酸酶：作用于核酸分子中的磷酸二酯键的酶，分解产物为寡核苷酸或核苷酸，根据作用位置不同可分为核酸外切酶和核酸内切酶。

12．限制性核酸内切酶：能作用于核酸分子内部，并对某些碱基顺序有专一性的核酸内切酶，是基因工程中的重要工具酶。

13．氨基蝶呤：对嘌呤核苷酸的生物合成起竞争性抑制作用的化合物，与四氢叶酸结构相似，又称氨基叶酸。 14．一碳单位：仅含一个碳原子的基团如甲基（CH3-、亚甲基（CH2=）、次甲基（CH≡）、甲酰基（O=CH-)、亚氨甲基（HN=CH-）等，一碳单位可来源于甘氨酸、苏氨酸、丝氨酸、组氨酸等氨基酸，一碳单位的载体主要是四氢叶酸，功能是参与生物分子的修饰。

第九章 核酸的生物合成

1．半保留复制：双链DNA 的复制方式，其中亲代链分离，每一子代DNA 分子由一条亲代链和一条新合成的链组成。 2．不对称转录：转录通常只在DNA 的任一条链上进行，这称为不对称转录。

3．逆转录：Temin 和Baltimore 各自发现在RNA 肿瘤病毒中含有RNA 指导的DNA 聚合酶，才证明发生逆向转录，即以RNA 为模板合成DNA。

4．冈崎片段：一组短的DNA 片段，是在DNA 复制的起始阶段产生的，随后又被连接酶连接形成较长的片段。在大肠杆菌生长期间，将细胞短时间地暴露在氚标记的胸腺嘧啶中，就可证明冈崎片段的存在。冈崎片段的发现为DNA 复制的科恩伯格机理提供了依据。

5．复制叉：复制DNA 分子的Y 形区域。在此区域发生链的分离及新链的合成。

6．领头链：DNA 的双股链是反向平行的，一条链是5/→3/方向，另一条是3/→5/方向，上述的起点处合成的领头链，沿着亲代DNA 单链的3/→5/方向（亦即新合成的DNA沿5/→3/方向）不断延长。所以领头链是连续的。

7．随后链：已知的DNA 聚合酶不能催化DNA 链朝3/→5/方向延长，在两条亲代链起点的3/ 端一侧的DNA 链复制是6

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不连续的，而分为多个片段，每段是朝5/→3/方向进行，所以随后链是不连续的。

8．有意义链：即华森链，华森????克里格型DNA 中，在体内被转录的那股DNA 链。简写为Wstrand。

9．光复活：将受紫外线照射而引起损伤的细菌用可见光照射，大部分损伤细胞可以恢复，这种可见光引起的修复过程就是光复活作用。

10．重组修复：这个过程是先进行复制，再进行修复，复制时，子代DNA 链损伤的对应部位出现缺口，这可通过分子重组从完整的母链上，将一段相应的多核苷酸片段移至子链的缺口处，然后再合成一段多核昔酸键来填补母链的缺口，这个过程称为重组修复。

11．内含子：真核生物的mRNA 前体中，除了贮存遗传序列外，还存在非编码序列，称为内含子。 12．外显子：真核生物的mRNA 前体中，编码序列称为外显子。

13．基因载体：外源DNA 片段（目的基因）要进入受体细胞，必须有一个适当的运载工具将带入细胞内，并载着外源DNA 一起进行复制与表达，这种运载工具称为载体。

14．质粒：是一种在细菌染色体以外的遗传单元，一般由环形双链DNA 构成，其大小从1??200Kb。

第十一章 代谢调节

1. 诱导酶：由于诱导物的存在，使原来关闭的基因开放，从而引起某些酶的合成数量明显增加，这样的酶称为诱导酶

2. 标兵酶：在多酶促系列反应中，受控制的部位通常是系列反应开头的酶，这个酶一般是变构酶，也称标兵酶。 3. 操纵子：在转录水平上控制基因表达的协调单位，包括启动子（P）、操纵基因（O）和在功能上相关的几个结构基因。

4. 衰减子：位于结构基因上游前导区调节基因表达的功能单位，前导区转录的前导RNA通过构象变化终止或减弱转录。

5. 阻遏物：由调节基因产生的一种变构蛋白，当它与操纵基因结合时，能够抑制转录的进行。

6. 辅阻遏物：能够与失活的阻碣蛋白结合，并恢复阻遏蛋白与操纵基因结合能力的物质。辅阻遏物一般是酶反应的产物。

7. 降解物基因活化蛋白：由调节基因产生的一种cAMP 受体蛋白，当它与cAMP 结合时被激活，并结合到启动子上促进转录进行。是一种正调节作用。

8. 腺苷酸环化酶：催化ATP 焦磷酸裂解产生环腺苷酸（cAMP）的酶。

9. 共价修饰：某种小分子基团可以共价结合到被修饰酶的特定氨基酸残基上，引起酶 分子构象变化，从而调节代谢的方向和速度。

10. 级联系统：在连锁代谢反应中一个酶被激活后，连续地发生其它酶被激活，导致原始调节信号的逐级放大，这样的连锁代谢反应系统称为级联系统。

11. 反馈抑制：在代谢反应中，反应产物对反应过程中起作用的酶产生的抑制作用。

12. 交叉调节：代谢产物不仅对本身的反应过程有反馈抑制作用，而且可以控制另一代谢物在不同途径中的合成。 13. 前馈激活：在反应序列中，前身物质对后面的酶起激活作用，使反应向前进行。

14. 钙调蛋白：一种依赖于钙的蛋白激酶，酶蛋白与钙结合引起酶分子构象变化，调解酶的活性。如磷酸化酶激酶是一种依赖于钙的蛋白激酶。

第十二章 蛋白质的生物合成

1．密码子（codon）：存在于信使RNA 中的三个相邻的核苷酸顺序，是蛋白质合成中某一特定氨基酸的密码单位。密码子确定哪一种氨基酸叁入蛋白质多肽链的特定位置上；共有64 个密码子,其中61 个是氨基酸的密码，3 个是作为终止密码子。

2．同义密码子（synonym codon）：为同一种氨基酸编码的几个密码子之一，例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码。

3．反密码子（anticodon）：在转移RNA 反密码子环中的三个核苷酸的序列，在蛋白质合成中通过互补的碱基配对，这部分结合到信使RNA 的特殊密码上。

4．变偶假说（Wobble hypothesis）：克里克为解释tRNA 分子如何去识别不止一个密码子而提出的一种假说。据此假说，反密码子的前两个碱基（3ˊ端）按照碱基配对的一般规律与密码子的前两个（5ˊ端）碱基配对，然而tRNA 反密码子中的第三个碱基，在与密码子上3ˊ端的碱基形成氢键时，则可有某种程度的变动，使其有可能与几种不7

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同的碱基配对。

5．移码突变（frame-shift mutation）：一种突变，其结果为导致核酸的核苷酸顺序之间的正常关系发生改变。移码突变是由删去或插入一个核苷酸的点突变构成的，在这种情况下，突变点以前的密码子并不改变，并将决定正确的氨基酸顺序；但突变点以后的所有密码子都将改变。且将决定错误的氨基酸顺序。

6．氨基酸同功受体（isoacceptor）：每一个氨基酸可以有多过一个tRNA 作为运载工具，这些tRNA 称为该氨基酸同功受体。

7．反义RNA（antisense RNA）：具有互补序列的RNA。反义RNA 可以通过互补序列与特定的mRNA 相结合，结合位置包括mRNA 结合核糖体的序列（SD 序列）和起始密码子AUG，从而抑制mRNA 的翻译。又称干扰mRNA 的互补RNA。 8． 信号肽（signal peptide）: 信号肽假说认为，编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N 末端带有疏水氨基酸残基的信号肽，它被内质网膜上的受体识别并与之相结合。信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔，随即被位于腔表面的信号肽酶水解，由于它的引导，新生的多肽就能够通过内质网膜进入腔内，最终被分泌到胞外。翻译结束后，核糖体亚基解聚、孔道消失，内质网膜又恢复原先的脂双层结构。

9. 简并密码（degenerate codon）：或称同义密码子（synonym codon），为同一种氨基酸编码几个密码子之一，例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码。

10.核糖体（ribosome）: 核糖体是很多亚细胞核蛋白颗粒中的一个，由大约等量的RNA和蛋白质所组成，是细胞内蛋白质合成的场所。每个核糖核蛋白体在外形上近似圆形，直径约为20nm。由两个不相同的亚基组成，这两个亚基通过镁离子和其它非共价键地结合在一起。已证实有四类核糖核蛋白体（细菌、植物、动物和线粒体）它们以其单体的、亚单位的和核糖核蛋白体RNA 的沉降系数相区别。细菌核蛋白体含有约50 个不同的蛋白质分子和3 个不同的RNA 分子。小的亚单位含有约20个蛋白质分子和1 个RNA分子。大的亚单位含有约30 个蛋白质分子和2 个RNA 分子。核蛋白体有两个结合转移RNA 的部位（部位和部位），并且也能附上信使RNA，简写为Rb。 11．多核糖体（polysome）:在信使核糖核酸链上附着两个或更多的核糖体。

12．氨酰基部位（aminoacyl site）：在蛋白质合成过程中进入的氨酰-tRNA结合在核蛋白体上的部位。

13．肽酰基部位（peptidy site）：指在蛋白质合成过程中，当下一个氨酰基转移RNA接到核糖核蛋白体的氨基部位时，肽酰tRNA所在核蛋白体上的结合点。

14．肽基转移酶（peptidyl transferase）：蛋白质合成中的一种酶。它能催化正在增长的多肽链与下一个氨基酸之间形成肽键。在细菌中此酶是50S 核糖核蛋白体亚单位中的蛋白质之一。

15．氨酰-tRNA 合成酶（amino acy-tRNA synthetase）：催化氨基酸激活的偶联反应的酶，先是一种氨基酸连接到AMP 生成一种氨酰腺苷酸，然后连接到转移RNA 分子生成氨酰-tRNA 分子。

16．蛋白质折叠（protein folding）蛋白质的三维构象，称为蛋白质的折叠。是由蛋白质多肽链的氨基酸顺序所决定的。不同的蛋白质有不同的氨基酸顺序，也就各自按照一定的方式折叠而成该蛋白质独有的天然构象。这个蛋白质折叠是在自然条件下自发进行的，在生物体内条件下，它是在热力学上最稳定的形式。多肽链在核糖体上一面延长，一面自发地折叠成其本身独有的构象。当肽链终止延长并从核糖体上脱落时，它也就折叠成天然的三维结构。 17．核蛋白体循环（polyribosome）：是指已活化的氨基酸由tRNA转运到核蛋白体合成多肽链的过程。

18．锌指（zine finger）：是调控转录的蛋白质因子中与DNA 结合的一种基元，它由大约30 个氨基酸残基的肽段与锌螯合形成的指形结构，锌以4 个配位键与肽链的Cys或His 残基结合，指形突起的肽段含12-13 个氨基酸残基，指形突起嵌入DNA 的大沟中，由指形突起或其附近的某些氨基酸侧链与DNA 的碱基结合而实现蛋白质与DNA 的结合。

19．亮氨酸拉链（leucine zipper）：这是真核生物转录调控蛋白与蛋白质及与DNA 结合的基元之一。两个蛋白质分子近处C 端肽段各自形成两性α-螺旋，α-螺旋的肽段每隔7 个氨基酸残基出现一个亮氨酸残基，两个α-螺旋的疏水面互相靠拢，两排亮氨酸残基疏水侧链排列成拉链状形成疏水键使蛋白质结合成二聚体，α-螺旋的上游富含碱性氨基酸（Arg 、Lys）肽段借Arg 、Lys 侧链基团与DNA 的碱基互相结合而实现蛋白质与DNA 的特异结合。 20．顺式作用元件（cis-acting element）：真核生物DNA 的转录启动子和增强子等序列，合称顺式作用元件。 21．反式作用因子（trans-acting factor）：调控转录的各种蛋白质因子总称反式作用因子。

22．螺旋环螺旋（helix-loop-helix）：这种蛋白质基元由两个两性α??螺旋通过一个肽段连结形成螺旋??环??螺旋结构，两个蛋白质通过两性螺旋的疏水面互相结合，与DNA 的结合则依靠此基元附近的碱性氨基酸侧链基团与DNA 的碱基结合而实现。 8