峰头沃，倭遁走，一直追至野马外洋，再击溃之。
当时因为倭寇猖獗，各乡村备受蹂躏，郡城虽然也屡有警，但终有城池及卫兵守御没有被陷过，因此城外居民纷纷进城避倭，散处城中以及各处寺观不计其数，人挤至无处居住而据地寝宿的。有倭寇侦探从漳泉潜来，化装为道士，造谣惑众，说马榴精出现，昏晚能诛蛊妇女，须鸣金击鼓，书符让避。城中有妇女受恐吓昏倒的，具金买符的很多，后府官以左道逐之，才逃去。但城中谣言惑众之说仍甚多，如有人说：正月初一夜，城门锁泣，流血如注。有人说，梦天上坠一火轮，中出石碣云：“我是天兵，放火杀人，毁土纪，灭土城，重熙岁，见太平”。台风暴雨也认为是妖孽出现，人心惶惶，意识祸之将至。这时候的城乡情况是极为混乱的。
第十次、十一次、十二次，嘉靖四十年（公元1561年），自夏至冬，倭寇来侵三次，“官兵”已完全不能抵御，当时的参将候熙，是漳州人，所带的兵都是自己家乡的无赖，不但对倭不抗，而且通倭。都司白震带徭兵来，却又同本地兵互相仇杀，甚至放火烧南关外，烟焰迷天，烧两日才熄，候白二人却袖手不管。兵内閧，倭寇就更纵横各地寇掠而没有顾忌了。城涵一带各乡皆被掠而至残破不堪，避乱入城者越来越多，晚上露宿，白天行乞的不计其数。群众明白了抗倭不能指望腐败的“官府”和放火的“官兵”了,于是自己组织起来，抗倭自卫。如芦浦乡（现在的濠浦）自倡组织乡团，群众动手筑堡，保卫自己家乡。倭寇多次进攻芦浦，都被击退。最后倭寇集中兵力强攻，众寡悬殊，芦浦危急，派人至城求援，“官府”却不管，参将候熙登北城谯楼，立视芦浦被攻破。倭寇破芦浦，恨群众屡击败其兵，对芦浦群众进行大屠杀，海水为赤。芦浦距莆城只四五里，“官兵”却不支援，致使群众抗倭力量终因无援力孤而失败。
11
第十三次，嘉靖四十一年（公元1562年）6月，倭寇由三江口登陆，聚集蔡垞、杭头等村。这时候莆田以及福清、惠安三县的各大村都潜伏倭寇间谍，莆田城被围不解，倭寇塞城濠上游水道，企图攻下城池，泊舟在城濠的的船户有千余人，以城濠被塞，水断交通也断。将影响其生计，于是自动向“官府”请愿，与倭寇决一死战，一鼓而歼灭倭寇百余人，倭寇已将散退，可是通倭的候熙兵却出面掩护倭兵，船民于是反胜为败执伤退走。群众的抗倭力量又被“官兵”出卖。又有华亭猎户（旧称虎匠）数百人，出面袭击驻杭头倭寇，还用毒弩射敌人，倭寇大败溃逃，移营在白杜。虎匠潜往埋伏，等待再歼倭寇，又被候熙兵告密，倭寇转道潜在林莽中伏击猎户，被伤百余人，猎户回华亭，不再出来。这二支抗倭力量都被官兵出卖了。
至9月戚继光奉命援闽，在福清牛田击破倭寇后，其残余又遁来莆与在莆
倭寇合，拟去惠安南辋。福清来的残寇因新败，不同意再远行，认为戚继光客兵不会久留，于是转踞莆城东二十里的林墩。林墩四面环河，通接海港，倭寇在这个险要地形上列柵踞守，又派遣降倭奸民四出侦察，作为耳目，而留四千多黠倭踞守巢穴。戚继光于9月12日从福清急行军70里，宿营烽头江口。分遣把总张谏、叶大正、金科、曹南金等带兵1600人与中军王辅、百户张元勋配合，留在烽头，限令13日到涵头，14日早到宁海桥，闻鼓即刻进攻。戚继光则亲督把总吴唯忠、胡大受、陈子銮、陈大受、王如龙、童子明等兵，在13日偃旗息鼓潜由囊山间道抵莆城。当时士兵行军辛苦，拟在城外宿营，戚继光认为倭寇侦探分布很广，筑城外容易泄密。分守翁时器也以客兵远道来支援，不敢催促出兵进攻，戚继光说道：“歼穷寇与方张者不同，方张者势众，能分袭，须正以临之，使其狡不得逞，伤弓之鸟，迟则飏矣，所谓拙速，所谓速雷也”。于是傍晚入城，假意从容宴谒，表示不马上进兵，却于半夜传铃吃饭后，
12
立即在东市集合，乘月由阳城、青浦至西洪。月还未落，就命令等待月落后进迫倭巢。天亮倭寇才发觉，尽集黠倭，列大队据小桥抵抗。这时戚继光发觉，原来向导通倭，留黄石大道给倭寇逃生之路，却引戚兵由西洪小路以入。西洪一带沟渠四布，小桥品列，只能鱼贯越河津涉沟堑，兵力不能施展，攻取不易。因之前哨官周能战死，首队34人及次队之兵，损失及半，血战一点多钟，三次都冲不上，于是士兵游水夺度，当时张谏等也在宁海桥击倭兵背后，倭寇才惊退入巢穴。可是戚兵的后援数百人也被倭寇袭击而溃退，戚继光斩临阵脱逃的哨长刘武等14人，后队才拼死奋战，击败倭兵。倭塞列靠水岸，狭巷委曲，经过短刃巷战，倭寇落水的千余。残余的逃至黄石的窑兜，从倭的漫山四散奔逃，真倭逃入瓦窑。戚兵以火药烧瓦窑，乘势杀入，杀俘很多。这一役，计斩首960人，焚溺2000多人，生俘男女26人，救出被俘男女2120人，戚兵阵亡周能等69人。这次出兵很密，至捷报大家才知道。中午，奏凯回莆城，群众扶老携幼郊迎十里，道路为之充塞。10月15日，戚继光班师回浙江，这是比较大规模歼灭倭寇的一个战役。
第十四次，嘉靖四十一年（公元1562年）11月，倭寇败遁入海，潜伏不动，但却极恨戚兵和不甘心失败。听到戚继光10月班师回浙江，大喜说：“戚老虎去矣，吾又何患”。就一支由上路陷福宁、政和，一支直逼莆田城。城被围困一个月，日夜盼望救兵不至。知府陈瑞龙亲自指挥守陴，命令无论乡绅士民，力能胜兵者，悉入兵籍。组织群众协力守城，日夜亲自巡游指挥，所以城虽久困却不陷。不幸瑞龙母卒，请求人来代理以便治丧，抚按留之。却因哀母和日夜指挥劳瘁卒。当陈瑞龙组织群众守城时，有不少群众来响应其号召，如陈延陛带其所组织的群众，进攻倭寇，一直至南沟牺牲；郡掾常白带群众缒西门出，伏击倭寇至牺牲。陈瑞龙死后，抚按令郡同知奚世亮摄府事。分守翁时
13
器懦弱无谋，兼且城中粮食将尽，有饿死的，又瘟疫大起，有死不得棺葬的，种种原因的影响，守城就不如陈瑞龙时严密了，所以倭寇更嚣张。巡抚游宏德遣总兵刘显率兵来救援，刘显却以兵寡为理由，屯江口桥不敢进。倭寇命降从的化装为群众，到江口假向刘显求援，刘显却实说兵少，俟再招募进兵，于是虚实被倭寇探悉了。等到招募令一出，倭寇就派漳泉人能讲莆田话的，混入新募兵中，刘却一点也不知道，反派他们入莆城助守。入城助守的由把总率领，计200人，背绣“天兵”二字，潜倭就混在中间，于是给倭寇送内应入城。11月28日，刘再派兵8人，穿天兵衣甲，送书给翁时器，被倭寇擒去，倭寇即穿其衣甲，持公牒骗得入城。知府奚世亮，通判李邦光有怀疑，翁时器不但不听，还令8人守北门，潜倭骗守城兵士说大兵约在晚上进攻倭寇，应该刁斗静俟。守城士兵信以为真，对守备表现松懈。当晚四鼓，守城士兵遂被杀，倭寇从城西北角四埔岭架梯上城垛，一面从城下发铳炮。大家还认为大兵果然在城外交战，但一看沿城垛已经都是军阀，抵抗已经来不及了。倭寇一入城，便乘风放火，各处居民房屋和官廨都起火。翁分守、举参将、李通判都越城逃跑，摄知府奚世亮、训导傅尧佐被杀死，莆田郡城就在11月29日天微明时陷入倭寇手中。莆田郡城遭受空前未有的浩劫，被烧杀劫掠一空。
倭寇陷兴化城后，御史李邦珍上疏告急，诏令巡抚游震待罪行间，又命谭纶抚闽，征召俞大猷为福建总兵，戚继光为副总兵，提兵前来破倭。俞大猷在嘉靖四十二年正月从江西昼夜兼程至。时郡城已陷二个月，各兵屡次被败，刘显、俞大猷各距倭50里驻营，按兵不动，等待戚继光兵来。当时倭寇也以城中尸首枕藉，腥秽不堪，财物又焚掠已尽，听说戚继光兵将到，就弃郡城去，南下破崎头城，杀都指挥欧阳深，攻陷平海卫城，招北路各倭兵同据平海城。俞大猷移兵秀山，刘显移兵明山，划地列柵坚守，贼屡挑战，仍按兵不动，移
14
缴催促戚继光兵。戚继光奉诏后，因兵少，就在义乌募兵，历时16日募得兵万余人。派胡守仁等6支兵先行到闽。3月抵达建阳，游中丞促其进兵，守仁因未奉将令不听，将这问题驰报戚继光，戚继光也以孤兵不宜先入，写信给中丞请罢进兵议。戚继光于四月初八日抵闽，游中丞有责其太慢之意，戚说是因新兵随募随发，并于路上边行军边训练。11月新中丞谭纶至，并委汪道昆监军。13日戚兵抵达福清，倭寇得悉，半数以上驾船贿赂海上许光朝所领水师，许光朝纵其逃遁。当时还有真倭三千及附从移兵在渚林迤南许家村据险结巢，分兵赤崎山下联为犄角。戚继光一面向莆田进兵，一面请中丞谭纶亲自来莆，俾便对俞、戚、刘三军统一布署进兵。戚继光兵17日趋烽头，18日过黄石，19日抵东亭，戚继光微服侦察倭营垒。20日谭纶、汪道昆同到渚林会集三大营布置机宜。以戚继光当中哨，俞、刘所部分左右哨，为犄角之势，冲锋悬示赏二万两，定21日进攻。20日夜四鼓，戚继光分三路衔枚进攻。至五党山侧岭，月光还很亮，就坐待月落，乘昧爽直迫倭巢，倭寇两千，前锋百余，乘马力拼冲突，鏖战一个多钟头，大败倭寇，追至许家大巢，四面合围血战，顺风纵火烧倭寇，倭巢尽扫。日午收兵，获得全胜，计擒斩倭寇2451人。夺获器械3961件，印信15颗。在莆田平海等地被虏的男女三千多人全部得救还，戚兵只阵亡16人。第二天中军总哨胡守仁等又分兵埋伏要道，追剿擒斩残寇171人，23日凯旋回莆城。
第十五、十六次，嘉靖四十二年（公元1563年）10月，残余倭寇又大举扰骚福建，我莆平海、南日再发生倭警，戚继光遣兵分路清剿，义总金科叶大正破倭寇于平海后潘及福宁、同峡，把总顾乔破倭于南日。寇掠未遂。
十一月初一，倭寇又驾舟16艘登犯吾莆青山，复犯晋江、福宁、连江、惠安等海岸，戚继光分兵追击最终在仙游剿灭之。倭寇祸莆历20余年，至此
15