中、上三个部分。下部由细晶泥质白云岩组成，缺乏硅质团块为其特征。与山凹丁群呈连续沉积。曾在其中采获：垂叶角石, 可本角等。为各地常见之早奥陶世早中期时代的产物。中、上部为含硅质结核、硅质条带白云岩组成，其中没发现化石。岩石硅化明显，因而其它各组情况，不甚清晰。但与邻区含山县相比较，不如它们发育齐全，汤山一带常以碳酸盐岩为主，厚度也稍有增加。可能本区以碳酸盐相发育为特征。
四、 志留系
志留系在巢南与巢北都比较发育，常组成背斜核部地层。但巢南、巢北的志留系沉积有明显差异，表现在巢北地区缺乏上统茅山组，而以中统坟头组直接与泥盆系五通组相接触。
五、 泥盆系
上统：五通组区内泥盆系分布广泛，但仅有上统五通组。根据岩性组合特征，可明显分为上、下两段。巢湖市北狮子口处剖面最为良好，其岩性可分上、下两段。 下段石英砂岩段。厚73.18m。下部的灰白色厚层或中厚层砾岩、砂砾岩、含砾石英砂岩组成。砾石成分以石英、燧石为主也含有细砂岩、粉砂岩、条带硅质岩等成分。砾径不同地点变化较大，一般2-5cm，个别达8cm以上。呈半圆到棱角状，层内见有15°倾角之斜层理。砾石层内反映多次沉积旋回。在巢北地区沿底部砾岩层追索，砾石分布极不均一，似呈瓣状砾石透统体状分布。上部厚层至中厚层，硅质胶结，中粒或中细粒石英砂岩夹少数泥质粉砂岩、泥岩层。石英砂岩中时可见大型单向斜层理及层面波痕，部分槽形斜层理。本段由于岩性坚硬在区内多组成山脊或陡壁。含化石甚少，仅见个别亚鳞木。
六、 石炭系
本区石炭系厚度不大，但发育齐全。分上、下二统。下统包括金陵组、高骊山组、和州组，老虎洞组巢北缺失，仅在巢南发育。上统包括黄龙组、船山组。除高骊山组为碎屑岩外，其余皆为碳酸盐沉积。
一、 高骊山组（C1g）
巢湖北部地区高骊山组比巢湖南部地区（28m）薄，而且相变明显。如凤凰山剖面本
组可分上、中、下三部分，厚12.15m。
下部：为灰、灰黄薄层粘土岩，底部夹褐铁矿（0.1-0.3m）层，含植物化石碎片，厚3.36m。
中部：灰黄、紫红薄层，含生物碎屑，含钙、铁质泥岩夹姜块状灰岩和中薄层含生物碎屑灰岩。厚5.03m。
上部：灰黄、黄褐色含铁质细粒石英砂岩及灰白色石英砂岩。层内虫迹构造发育，自下而上，自成一水平管迹、V-Y形管迹、似甲壳状 管迹之组合，厚4.25m。
二、和州组（C1h）
巢湖北部地区的和州组以歫嶂山剖面较为完整，按岩性特征可分为上、下两部分，厚26.81m。
下部：深灰、灰黑色中薄至厚层生物碎屑白云质灰岩、泥质类岩。厚22.53m。 上部：灰、微带肉红色中厚层至厚层亮晶及微晶生物碎屑灰岩，底部为粗结晶灰岩，顶部为炉渣状灰岩。厚4.28m。
三、黄龙组（C2h）
黄龙组在长江沿岸一带一般由三部分组成，即：浅、微红纯灰岩、粗晶灰岩（有人称砾晶灰岩）、白云岩。下部白云岩段在南京到江北一带又称为老虎四组，属早石炭晚期。而中上部粗晶灰岩、纯灰岩段属黄龙组。
下部：灰、深灰、肉红色中厚至厚层生物碎屑泥晶与微晶灰岩。厚16.74m。 上部：灰、紫红色厚层亮晶生物碎屑灰岩夹砂屑灰岩。厚10.50m。
四、船山组（C2c）
本组岩性以含球藻灰岩为特征，厚8.26m。在巢湖北部岠嶂山一带可分为两部分： 下部：黑色厚层微晶灰岩，底部有一层灰黄色含碣铁矿团块泥岩。厚1m多，含：石炭皱戟贝 ,舒克贝,泥岩中含植物碎片化石。
上部：灰、深灰色中厚至厚层状，亮晶生物碎屑球藻灰岩，夹灰色泥晶生物碎屑灰岩。
七、二叠系
巢湖北部地区的二叠系分布在马家山及俞府大村一带由下统：栖霞组、孤峰组、银屏组，上统龙潭组、大隆组组成。总厚288.41-487.84m。 下统： ①、栖霞组（P１g） 按巢湖市北部北平顶山剖面 自下而上可分为两段六部分。厚61.60m。可分为两部分：
下部：为碎屑岩夹劣质煤，平顶山剖面碎屑岩风化为土黄色风化物。该部分岩性变化较大，在岠嶂一带为深灰色、灰黄色钙质透镜体泥岩，厚0.25m，向西到东风石矿为灰黑色页岩及黑色劣质煤层，厚0.75m，与下伏船山组呈凹凸不平之假整合面。 上部（臭灰岩层）：深灰、灰黑色薄至中层含沥青质臭灰岩及含生物碎屑泥灰岩，厚60.60m。 上段： 厚109.67m。可分为四部分。 下部（下硅质层）：含燧石结核或团块灰岩，黑、灰黑色灰岩，夹黑色薄燧石层及生物碎屑粉砂质泥岩。厚8.74m。 中部（合燧石结核灰岩层）：深灰、灰黑中薄到中层含燧结核灰岩，夹黑色薄层含沥青质泥类岩，厚78.14m。 上部（上硅质层）：黑色中薄层硅质岩、深灰色含燧结核白云质灰岩及薄板状硅质灰岩互层。厚7.66m。 顶部（顶部灰岩层）：灰、深灰色含燧石结核灰岩、白云岩质灰岩。厚14.86m。上述剖面自下段上部起至上段顶部各地发育都较稳定，但其厚度在巢南地区大于巢北地区。本区以拟纺缍蜒带或米森珊瑚带之顶界为栖霞组之顶界。
巢湖地区综合地层简表 代 纪 世 组 代号 厚度岩 性 描 述 （cm） 新 生 三 代 叠 纪 殷 坑 组 早 和龙山组 T1h T1y 29 125 南陵 湖组 T1n 160 中 东马鞍山组 T2d 96 侏罗纪 早 第四纪 更 新 世 晚 下蜀组 Qpx 2—38 全 新 世 芜 湖 组 Qhw ＞10 上段：灰黄色粉质亚粘土，含砾粗砂，底为锈黄色铁锰层。中段：灰黄色粉质重亚粘土，棕褐色粗砂夹浅灰色粉质重亚粘土。下段：灰黄色粉质轻粘土，砂、砂砾。 黄褐色含铁锰结核粉质轻粘土，下部含钙质结核。 泊岗 组 毛坦厂组 磨山组 J1m ＞20 Qpb J3m ＞151 1—51 浅棕红色微含砂粉质轻粘土，粉质重亚粘土，碎砾层，铁皮层山麓带青灰色含砾粘土夹砂、亚砂土透镜体。 紫灰色安山岩，粗安质火山角砾岩夹凝灰质岩屑细砂岩、粉砂岩。 砖红色中厚层砂砾岩与细粒岩屑、长石砂岩 上部：灰黄色厚层状角砾状灰岩、泥质白云质灰岩。下部灰色薄—中层灰岩，灰紫色含石膏假晶灰质白云岩。 上部：薄层深灰色灰岩夹炭质页岩。中段：灰绿色中薄层瘤状灰岩、厚层灰岩、钙质页岩。下段：深灰色厚层灰岩微红色中薄层瘤状灰岩夹钙质泥岩。 上部：灰色薄层灰岩夹黄绿色薄层似瘤状泥质灰岩、泥岩。下部：灰绿色紫色薄层似瘤状灰岩、钙质泥灰岩。 上部：灰绿色钙质页岩夹薄层泥质灰岩及带状白云质灰岩。中部：灰黄色粉砂质泥岩夹灰色中薄层泥似瘤状带灰岩。下部：浅灰、黄绿色泥岩、含粉砂质泥岩夹似瘤状灰岩。 古 生 代 大隆组 P2d 30 上部：灰黑色薄层硅质炭质泥岩夹灰质白云质泥岩。中部：紫灰色泥岩灰黑色炭质页岩、硅质页岩。下部：灰黑色薄层硅质岩、炭质硅质岩夹泥岩、页岩。 二 叠 纪 晚 龙潭组 P2l 74 上段：灰黑色粉砂岩、泥岩夹煤线，顶部灰黑色中厚层泥晶白云质灰岩。下段：灰黄色中厚层细粒岩屑长石石英砂岩、泥岩夹黑色硅质岩。 早 孤峰组 栖霞组 P1g 54 上部：浅紫、黄褐色薄层硅质泥岩。中部：灰黑色薄层放射虫硅质岩。下部：灰黄色粉砂岩、泥岩、页岩。 P1q 209 上段：黑色中厚层含燧石团块含泥质灰岩、白云质灰岩。下段：深灰色薄—中层状含沥青质臭灰岩及含生物碎屑灰岩，底部黄黑色碎屑岩夹劣质煤。 晚 船山组 C3c 11 上部：灰色中—厚层亮晶生物碎屑灰岩、球藻灰岩。下部：黑色厚层微晶灰岩，底部灰黄色含褐铁矿团块灰岩。 中 石 炭 黄龙组 C2h ＞27 上部：灰、紫红色厚层亮晶生物碎屑灰岩夹砂屑灰岩。下部：浅灰、肉红色厚层状生物碎屑泥晶与亮晶灰岩。 和州组 C1h 27 上部：灰、浅红色中—厚层亮晶生物碎屑灰岩，顶部炉渣状灰岩。下部：灰黑色生物碎屑白云质灰岩、泥岩。