NTSYSpc软件的使用：
(1) 利用NTSYS软件计算品种间遗传距离
1．将已赋值好的Excel文件放于桌面，假设命名为A.xls，保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式，即A1=1，表示出现等位基因；B1=132，表示等位基因数，C1=189表示品种数；D1=0表示不出现等位基因。从A3开始，在第一列标上所有的SSR引物，从B2开始，第二行标上所有的品种名，由此得到一个数据矩阵。
2．双击NTSYS软件，选择file→edit file，选择A.xls文件，将出现NTedit1.2编辑器，点击file→sale file as选项，将导入的Excel文件转换为软件识别的格式，命名为A-1.NTS文件。
3．点击Ntsyspc2.1界面的“Similarity”，点击“Genetic distance”；在Input data file中输入A-1.NTS；在Output file中输入A-2.NTS，点击Compute；则计算好的遗传距离放在A-2.NTS文件中。
4．点击Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file，选择A-2.NTS，即可查看到品种间的遗传距离。
(2) 利用NTSYS软件构建树状图
1．双击NTSYS-PC，点击similarity→Qualitative data→Input data file,选择A-1.NTS文件，在Output file中输入B-2文件，点击Compute；
2．点击clustering→SHAN→input file，选择B-2→Output file中输入B-2文件→In case of ties改为Find→compute计算完成。
3．点击Graphics→tree plot→input file，选择B-3→compute，即可出现聚类图。
4．点击Tree Plot界面上的Options→plot Options；会出现一个对话框，里面可对聚类图进行页面显示等相关操作。点击Tree Plot界面上的Edit项，可进行复制等操作
楼主的结果正是我想要的，我的问题就在于 最开始的excel数据怎么input的问题，总是提示我格式不对什么的～～
我不知你是怎么做的,你按照以下的方法试试,DDE和OLE格式可能与microsoft office的版本有关,使用OLE方式应该就没有什么问题了.如果还不行那就是软件的问题了.
5． 6． 7．
8．2.5 其他数据的聚类方法与此类似，在此不再赘述。
应楼主的要求,将前些天的帖子按标准格式发表.
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=1354147&sty=1