房地产开发企业支付给城镇单位及个人的拆迁补偿费应凭下列资料和凭证扣除：
（一）应提供的资料：房屋拆迁许可证、房屋拆迁公告（房屋征收决定）、安臵方案、被拆迁房屋价值评估报告、与被拆迁人订立的拆迁补偿安臵协议、拆迁合格证。 （二）应具备的扣除凭证：
1.房地产开发企业如委托拆迁中介机构进行拆迁的，凭拆迁中介机构开具的正式发票确认支付的拆迁费用；
2.房地产开发企业支付个人拆迁补偿费的，应按规定取得对方个人签名或者盖章的收条，也可以开列有个人签名或盖章的支付清单，同时应做到拆迁（回迁）合同、签收花名册或签收凭证、被拆迁人身份证复印件一一对应；
3.房地产开发企业支付被拆迁单位补偿费的，分别不同情况进行处理: （1）若能提供县级以上(含)地方人民政府出具的收回被拆迁单位土地使用权文件，或者土地管理部门报经县级以上(含)地方人民政府同意后由该土地管理部门出具的收回被拆迁单位土地使用权文件的，可按拆迁补偿协议及付款凭证、收款收据确认扣除项目金额；
（2）无法取得上述文件的，应以正式发票作为确认扣除项目金额的依据；
（3）无法提供正式发票或收回土地使用权文件的，不予扣除。 十三、关于合作建房的土地增值税征免税问题
（一）对一方出土地，一（多）方出资金，不成立合营企业，并同时满足以下条件的合作建房行为，在进行土地增值税清算时适用本条第二款的规定：
1、合作建房各方需签署合作建房协议并以合作各方名义共同办理合建审批手续；
2、合作建房各方需依法共同办理国有土地使用权权属变更登记； 3、合作建房各方至少有一方应该具有房地产开发经营资质。 （二）对于同时满足本条第一款所列条件的合作建房，按以下规定进行土地增值税税务处理：
1、建成后按合作协议各自办理初始确权，分房自用的，暂免征收土地增值税；
2、对出土地方将分回房屋在初始确权后再转让的，应按规定征收土地增值税，同时将因合作建房而转让出去的部分土地的历史成本调整为分回房屋的建造成本，按规定予以计算扣除；
3、对出资金方将分回房屋在初始确权后再转让的，应按规定征收土地增值税，同时将合作建房时发生的还建房开发成本支出调整为分回房屋的取得土地使用权支付的地价款，按规定予以计算扣除； 4、对合作方按照合作建房协议的约定支付的补差款，出土地方和出资金方应按实际支付或收到的价款，相应调整其分回房屋的建造成本和取得土地使用权支付的地价款；
5、除在合作建房协议中约定的分配房屋外，一方通过另行约定的方式（包括签订专门条款、合同、补充协议等）将原分配给自己的房屋
再转让给其他合作方的，不管转让方是否开具发票，均视同销售不动产处理。其按合同约定的价格取得的转让收入应计入土地增值税应税收入。若转让价格明显偏低，又无正当理由的，应按下列方法和顺序确认：
（1）按本企业在同一地区、同一年度销售的同类房地产的平均价格
（2）由主管税务机关参照当地当年、同类房地产的市场价格或评估价值确定。
上述所称“同一年度”、“当年”是指其作出约定并签署协议的当年。 十四、关于以土地使用权（房地产）投资入股，被投资企业从事房地产开发的，其取得土地成本的确认问题
房地产开发企业以接受投资方式取得的土地使用权（房地产），根据有关文件的规定，此类情形以财政部、国家税务总局《关于土地增值税若干问题的通知》（财税?2006?21号）规定的执行日期为界限，分两种情况确认土地成本：
1、以土地使用权（房地产）作价入股进行投资或联营的，在投资或联营环节对土地使用权（房地产）进行评估，并按照评估的市场公允价值入账的，以入账的公允价值作为被投资企业取得土地使用权（房地产）所支付的金额。
2、以土地使用权（房地产）作价入股进行投资或联营的，如一方是房地产企业的，按照财税【2006】21号文规定对以土地使用权（房地产）作价入股进行投资或联营的一方应征收土地增值税，计税收入按
照作价入股时经评估取得的公允价值；接受投资一方再次转让土地（房地产）的或进行房地产开发对外销售的，在计算土地增值税时，应以接受投资时入账的公允价值作为被投资企业取得土地使用权（房地产）所支付的金额。
十五、关于房地产开发企业提供的材料（动力）的扣除问题 （一）对于房地产开发企业自购工程用材料（即甲供材料，包括工程合同或者协议确定由房地产开发企业承担的水电等工程动力价款）的包工不包料建安工程，施工方（或项目所在地主管税务机关）应按提供的建安劳务金额（不含材料价款）开具发票。在计算土地增值税扣除项目时，施工费用的扣除凭证以建安发票为准，材料和设备费用的扣除凭证以销售发票为准；
（二）开发过程中房地产开发企业已先行代垫，在工程结算时向施工企业收取的临时水电费不得计入建筑安装工程费扣除项目； （三）对于有关甲供材料（动力）情况，房地产开发企业应在清算申报时、中介机构应在鉴证报告中予以披露。主管税务机关应按管理权限对甲供材料（动力）涉及的建筑业营业税等税种申报缴纳情况进行核查，或将相关信息反馈给施工单位的主管税务机关。 十六、关于房地产开发企业取得的异地工程发票的扣除问题 （一）通常情况下，清算项目建安工程应按劳务发生地征税原则取得从项目所在地税务机关领取并开具的发票（或由项目所在地税务机关代开的发票）。对于房地产开发企业取得的异地建安工程发票，应视同不合法票据，不予扣除。但经主管税务机关查实上述劳务确属真实
发生的，由施工企业或个人重新提供项目所在地建筑业发票后，可予以扣除。
（二）施工企业或个人发生旧《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》第三十条、现行《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》第二十六条规定的情形，由其机构所在地或居住地主管地税机关补征营业税并开具发票的，主管税务机关可凭异地工程发票、施工企业或个人主管地税机关出具的相关证明、税收缴款书复印件（上面必须有加收的滞纳金）等资料确认扣除项目金额并予以扣除。 十七、关于房地产开发企业公共配套设施费计算扣除的问题 房地产开发企业开发建造的与清算项目配套的居委会和派出所用房、会所、停车场（库）、物业管理场所、变电站、热力站、水厂、文体场馆、学校、幼儿园、托儿所、医院、邮电通讯等公共设施，按以下原则处理：
（一）在《商品房购销合同》中已注明建成后产权属于全体业主所有的，其成本、费用可以扣除；未注明的，凭房地产开发企业在当地主要媒体上刊登的移交公告或小区业主委员会出具的移交证明，其成本、费用可以扣除；
（二）建成后无偿移交给政府、公用事业单位用于非营利性社会公共事业的，凭移交清单或接收清单，其成本、费用可以扣除；属于政府、公用事业单位原因不能及时接收的，经接收单位或者政府部门出具证明，经主管税务机关确认后，其成本、费用可以扣除；