BRB-ArrayTools使用手册

BRB-ArrayTools Version 3.7

User’s Manual

by

Dr. Richard Simon Biometrics Research Branch National Cancer Institute

and Amy Peng Lam The EMMES Corporation

November, 2008

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Translated by Yujian

Dec, 2008

目录

目录 绪论 软件目的 软件功能概览 单通道实验须知

软件安装 系统需求 安装软件

加载到Excel

整理数据 整理过程概览 整理过程中的数据输入 使用整理对话框 整理步骤的输出

筛选数据 点样筛选 数据转化 基因筛选 基因子集

注释数据 使用基因列表定义基因注释 自动导入基因注释 Gene Ontology

数据分析 散点图工具 层次聚类分析工具 样本的多维尺度化 使用分类预测工具 分类比较分析 分类预测分析 生存分析 数量性状分析 预测分析、生存分析和数量性状分析工具中的某些可用选项 随机方差模型 用于控制假阳性比例和个数的多元置换检验

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指定重复实验和配对样本 GO数据库的观测值与期望值分析 ArrayTools中的可编程插件 已预装的插件

更多帮助 一些小技巧 安装问题答疑

汇报问题 参考文献 感谢 写在最后

绪论

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