s1 gap X 选择那些原子，其van der Waals半径至少和s1的van s1 gap X der Waals半径相差X Pymol> select farfrm_ten, resi 10 gap 5 选择以s1中任何原子为中心，X为半径，所包括的所有s1 around X s1 a. X 原子 Pymol> select near_ten, resi 10 around 5 选择以s1中任何原子为中心，X为半径，然后把s1扩s1 expand X s1 e. X 展至该新的范围所包含的所有原子 Pymol> select near_ten_x, near10 expand 3 s1 within X s1 w. X 选择以s2为中心，X为半径，并包含在s1中的原子 of s2 of s2 Pymol> select bbnearten, bb w. 4 of resi 10 byres s1 br. s1 把选择扩展到全部residue Pymol> select complete_res, br. bbnear10 把选择扩展到全部object Pymol> select near_obj, bo. near_res 选择直接和s1相连的原子 Pymol> select vicinos, nbr. resi 10 byobject s1 bo. s1 neighbor s1 nbr. s1 这些逻辑选择还可以组合使用。比如你想选择chain b，但是不选择其中的residue 88：
Pymol> select chain b and (not resi 88)
在使用多重逻辑选择时，为了让Pymol正确处理顺序，请使用括号，这样最里层括号里面的内容将会被最先处理，以此类推。
好了，目标选择就先说到这里。其实关于目标选择还有所谓的“宏”可以用，可以简化表达式，准备下次说说。 by Wei Lü - www.donkeyhome.org
PyMOL用法（教程三）
Pymol的选择宏
上次具体讲了如何在Pymol中怎么用selection-expression选取目标，其实在某些情况下，还可以用Pymol提供的宏来选择操作目标。使用这个选择宏往往可以是一个原本很复杂的表达变得简单紧凑。
例如我们想选择2vlo这个pdb文件中的\中的第100个基团的α炭原子，如果用selection-expression来表达的话是这样： Pymol> select chain a and resi 100 and ca 如果用宏的，可以这样： Pymol> select a/100/ca
是不是觉得简单了很多。好了，下面就来详细讲讲这个宏吧。
因为这个宏是用来选择目标的，所以我称之为选择宏，它用斜杠\来定义Identifier，并且它使用上次介绍过的逻辑操作子\。 一个完整的，按顺序的选择宏的表达如下：
/object-name/segi-identifier/chain-identifier/resi-identifier/name-identifier
之所以说选择宏是有顺序的，是因为Pymol就是靠顺序判断每个斜杠后面的东东都是什么东东。
如果再细分一下的话，其实这个选择宏有2种写法，一个是带开头的斜杠，另一个是不带开头斜杠。区别是： 如果不以斜杠开头，那么Pymol则认为你的表达式的最后一项就是选择宏的末尾的最后一项，也就是name-identifier。例如： Pymol> show lines, a/100/ca Pymol> show lines, 100/ca 如过以斜杠开头，那么Pymol就认为你是从选择宏的表达式的顶端开始的，也就是从/object-name开始的。例如： Pymol> zoom /2vl0//a/100/ca Pymol> zoom /2vl0//a/100
细心的读者肯定发现了上面的例子中有两道斜杠中间什么内