微生物鉴别
②性状编码将观察和测得的性状用计算机所能识别和运算的符号记录下来。以分类中用得最多的两态性状，如对某种碳源利用与否，有无某种酶，能否在45°生长等为例，阳性结果（能利用某种碳源，有某种酶，能在45°生长等）用“+”表示，阴性结果用“-”表示。如资料缺乏或可疑，可用“NC”表示。对于定量多态性状或定性多态性状采用加权递增编码法，将1个多态性状转化成多个3态性状。将性状编好码后，把它们排列成顺序号，形成一个性状（原始数据）矩阵，然后输入计算机。输入计算机时分别用1和0表示，“NC”输入计算机时用“3”代表。
③相似度系数的计算：相似度系数是被比较的OTU对偶间整体相似程度的度量，它是根据每一对性状的相似程度计算出来的。计算相似度的方法很多，最简单的方法是计算对偶间相似性状的数目。
其计算公式如下： S=NS/（NS+ND）
上式中的NS表示比较的OTU对偶有相同性状的数目，ND表示被比较的OTU对偶有不同性状的数目。算出的相似度以百分数或比例表示。
④系统聚类（或等级聚类）：根据相似度系数对OTU进行系统（或等级）聚类归群，得到相似度矩阵，即S矩阵。如对10个菌株进行数值分类，经过系统聚类可得到S矩阵，相似度为百分数，100表示每个OTU自己与自己相比。
⑤聚类结果的表示：从矩阵看不出这10个菌株间的相互关系，因此需要对矩阵进行重新处理，将相似度高的和低的分别列在一起，得到另一组矩阵。
然后再由此矩阵转换成能显示这10个菌株相互关系的树状谱。数值分类得到的是表观群。实践证明，表观群是等同于分类单元的。大约是75%相似度的表观群可视为同一种，比值达65%以上者可归入同一属。这样的结论和传统分类方法的结果通常是一致的。
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附录1
附录1：
物料、容器具、工具进出洁净区标准操作规程
4.1所有进入洁净区的物料（原辅料、胶塞、铝塑盖）、容器具、工具、动态监测用培养基、生产记录用纸、中控取样的容器具必须从专门的物流通道进入。 4.2大型器具进入洁净区，在车间大消毒前清洁后进入车间。 4.3任何时候，缓冲间和传递窗的两侧门都不能同时开启，用后随手关闭。 4.4进入C级程序
4.4.1原辅料进入C级区时由领料人员在清外包间脱去外皮，同时在内包装表面粘贴状态标志，标明与外包装一致的品名、规格、批号，然后用75%乙醇溶液擦拭消毒后放进原辅料传递窗（编号：FZ-D-050)，开启风机和紫外线照射30 分钟。同步填写传递窗紫外线使用记录和物料进出记录。消毒结束后在C级区传递窗取出后送至原辅料暂存间并悬挂状态标志。
4.4.2胶塞、铝塑盖进入C级区时由领料人员在清外包间脱去外皮，只留一层内包装袋，然后用75%乙醇溶液擦拭内包装袋表面后放进物料传递窗（编号：FZ-D-049)，开启风机和紫外线照射30 分钟。同步填写传递窗紫外线使用记录和物料进出记录。消毒结束后在C级区传递窗取出送至胶塞、铝盖暂存间悬挂状态标志。
4.4.3容器具、工具、中控取样的容器具进入C级区时由在清外包间用75%乙醇溶液擦拭表面后放进物料传递窗（编号：FZ-D-049)，开启风机和紫外线照射30 分钟。同步填写传递窗紫外线使用记录，消毒结束后在C级区传递窗取出送至使用岗位。
4.4.4环境监测用仪器、培养基的外包装用75%乙醇溶液擦拭表面消毒后放进物料传递窗（编号：FZ-D-049)，开启风机和紫外线照射30 分钟。同步填写传递窗紫外线使用记录。消毒结束后在C级区传递窗取出后送至使用岗位。
4.4.5生产用纸笔放进物料传递窗（编号：FZ-D-049)开启风机和紫外线照射30 分钟。同步填写传递窗紫外线使用记录。消毒结束后在C级区传递窗取出后送至使用岗位。
4.5 进入A/B级区净化程序：所有进入A/B级洁净区物料、容器具、工具等物品都必须进行除菌、灭菌或有效的消毒措施后，方可进入。
4.5.1药液、消毒剂、清洁用水等必须经0.22um滤芯（膜）除菌过滤后在A/B级洁净区内接收，存放于指定的容器中密闭存放。 4.5.2管制抗生素瓶通过隧道烘箱灭菌后进入A/B级洁净区。
4.5.3注射用无菌冷冻卤化丁基胶塞经清洗、灭菌后在A/B级洁净区内开门取出，密闭存放。 4.5.4取样器具、容器具、清洁工具等在C级容器具清洗间清洗后，经RXH-B干热灭菌柜或SCM-D-JSB
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附录1
脉动真空灭菌柜湿热灭菌后从A/B级洁净区一侧开门取出使用。
4.5.5 在C级区将悬浮粒子计数器、浮游菌采样器用消毒剂浸湿洁净抹布全面擦拭表面，放入传递窗（编号：FZ-D-046)后，开启风机及紫外灯照射30分钟后，从B级区取出。
4.5.6在C级区将培养基脱掉外包装后用75%乙醇溶液浸湿洁净抹布擦拭表面，放入传递窗（编号：FZ-D-049)，开启风机及紫外灯照射30分钟后，从B级区取出。
4.5.7将记录纸平摊于传递窗（编号：FZ-D-049)，开启风机及紫外灯照射30分钟后，从B级区取出，与环境空气一并经臭氧消毒60分钟后使用。 4.6出洁净区：
4.6.1灌装岗位剩余药液、清洁废水等液体用专用容器，经传递窗送至C级地漏排出。 4.6.2灌装岗位剩余胶塞用无菌袋装好经传递窗传出，当废弃物从C级废弃物通道传出洁净区。 4.6.3灌装岗位剩余管制抗生素瓶经传递窗传出，从C级废弃物通道传至理瓶岗位。
4.6.4灌装、出箱岗位的废弃物均从传递窗送出A/B级洁净区域。再从C级废弃物通道传至垃圾站。 4.6.5轧盖岗位剩余的铝塑盖用无菌袋装好退回铝塑盖清洗岗位。
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附录2
附录2：
A(B)级洁净区清洁消毒标准操作规程
4.1清洁频率及范围：
4.1.1每次生产后进行一次清洁、消毒剂擦拭，每班生产结束后用臭氧对洁净区空气消毒60分钟。 清洁范围：操作台面、门窗、墙面、地面、用具及附属装置、设备的外壁等。
4.1.2每月用甲醛对室内薰蒸消毒一次；若遇异常情况或停产三天以上启动生产时，用甲醛进行消毒。 4.1.3每周星期六工作结束或甲醛薰蒸后，进行全面清洁、消毒1次。
清洁范围：以消毒剂擦拭室内一切表面，包括：天棚、灯具、墙面、门、窗框及玻璃、回风口、设备设施、室内公用设施管线、工作台面及桌腿的表面，然后再擦拭一遍工作电话机、手推车、维修工具等辅助用具。
4.1.4连续生产，两班生产时间间距应在4小时以上，以保证足够的清洁消毒时间。 4.1.5 A/B级区域更衣室、缓冲间及公共设施，每日进行清洁、消毒一次。 4.2 清洁剂、消毒剂使用方法： 4.2.1清洁剂：注射用水。
4.2.2 用于表面消毒的有：0.1%新洁尔灭溶液、75%乙醇溶液。
4.2.3 用于空间消毒的有：臭氧、甲醛。
4.2.4清洁剂及配制后的消毒剂必须除菌过滤后A/B级方可使用。
4.2.5清洁剂的接收：A/B级操作人员将已灭菌的10×16的硅胶管安装到消毒液接收口上。通知消毒液配制人员开始过滤注射用水，A/B级操作人员根据使用量将注射用水接收到已灭菌的不锈钢桶中使用。接收完毕，通知消毒液配制人员。
4.2.6消毒液的接收：接到消毒液配制人员接收通知后，A/B级操作人员根据使用量将消毒液接收到已灭菌的不锈钢桶中使用。接收完毕，通知消毒液配制人员。 4.2.7清洁剂及配制后的消毒剂从除菌过滤后到使用不超过48小时。 4.2.8 各种消毒剂每月轮换使用。
4.3 清洁方法
采用“三桶法”：二号桶（盆）装清洗用注射用水或消毒剂，为擦拭后的洁净抹布清洗用，可反复使用；一号桶（盆）装新鲜的注射用水或消毒剂，为清洁后的洁净抹布浸湿用，三号桶为废弃液收集桶。如需要更换注射用水或消毒剂，二号桶（盆）的清洗用注射用水或消毒剂倒入三号废弃液收集桶；一号桶（盆）的新鲜的注射用水或消毒剂倒入二号桶（盆）作清洗用；一号桶（盆）重新接取新鲜的注射用水或消毒剂，往后以此类推。
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附录2
用不锈钢桶（盆）接入已除菌过滤的注射用水或消毒剂，每次须倒约1L，擦拭约10m2的面积后将洁净抹布清洗干净，再更换新的清洁剂或消毒剂。
清洁原则：生产结束后，先将室内有污迹和粉尘的表面用注射用水清洁干净，然后用消毒剂对所有的表面进行擦拭一遍，最后再用注射用水将已消毒表面残留的消毒剂清除干净，防止造成二次污染。擦拭时，按照从上向下、从内向外、先物后地的顺序进行操作。且每个部位每次擦拭时间2min以上。
4.3.1顶棚、墙壁（门、窗）的清洁
4.3.1.1用不锈钢盆接1L注射用水，将绿色专用丝光抺布放入注射用水中浸湿，保证抺布表面浸湿均匀，用抺布包裹在T字清洁架上进行表面擦拭。
4.3.1.2 每次用浸湿的抺布清洁顶棚、墙壁（门、窗），T字清洁架的擦拭方向应是从里往外、从上到下，只能单方向擦拭；从室内的最远端开始清洁，至通往缓冲间的通道处结束，要保证所有区域都能清洁到位并及时更换清洁用水。
4.3.1.3按上述方法清洁一遍，清洁后的清洁用水另用带盖的不锈钢桶集中收集，统一传至C级区排放。
4.3.2隔离系统及FFU层流的清洁
4.3.2.1用不锈钢盆接1L注射用水，将绿色专用丝光抹布放入注射用水中浸湿，保证抺布表面浸湿均匀，用洁净抺布包裹在T字清洁架上，从隔离系统及FFU层流外表面上端向下面用T字清洁架清洁，每擦拭一面区域应对抺布进行清洁并及时更换清洁用水。 4.3.2.2隔离系统及FFU层流的底部散流板用手工擦拭，保证每块地方都擦拭到，擦拭方向应是从里往外、从上到下，只能单方向擦拭。
4.3.2.3按上述方法清洁一遍，清洁后的清洁用水另用带盖的不锈钢桶集中收集，统一传至C级区排放。
4.3.3表面的清洁（设备、工作台面、仪器等）
4.3.3.1用不锈钢盆接1L注射用水，将绿色专用丝光抹布放入注射用水中浸湿，保证抺布表面浸湿均匀，机器、设备按照从上到下、从后到前的顺序清洁。当遇到难接触的附件时，应用镊子夹着抺布进行清洁。
4.3.3.2每擦拭完一个设备附件时都应对抺布进行清洗。
4.3.3.3按上述方法清洗一遍，清洁后的清洁用水另用带盖的不锈钢桶集中收集，统一传至C级区排放。
4.3.4回风口、地面的清洁
4.3.4.1用不锈钢桶接1L注射用水，将蓝色专用丝光抹布放入注射用水中浸湿，保证抺布表面浸湿均匀，取出拧干后先清洁回风口边框再对叶片进行擦拭，再用抺布包裹在T字清
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