1. 将对接好的ligand和蛋白merge(好像每次只能用一个ligand和一个蛋白,否则pymol里会把几个ligand当作一个
2. Merge后export structure,存成pdb格式 3. 在pymol中打开.pdb
4. 在里面找出ligand,点sele的A(action)/rename
Rename这个ligand,这里命名为lig 5. 选all,H(hide)everthing 6. 选lig，S(show)sticks
7.2j50(就是那个蛋白)S/cartoon
8.在后面的color调整颜色,这里ligand选by element
2j50选white
9.下面显示氢键,点击2j50的Action,选择find/polar contacks/to other atoms in object,氢键就出来了
10.然后再找氢键作用的残基，可以在上面直接点选，但最好找出氨基酸代码来选取（因为
这里面点不准）
Rename它们，以便以后好找，这里rename为res，show它们为line，color为by element
11.再选display，将background改成white
12.然后分别点选这几个res(因为颜色不同,所以很容易找出来),右键label/residues
13.label出来后,还可以调整它们的位置,点一下左图viewing,就变成了右图的editing,这时就可以按住ctrl键拖动label的位置了
12.大体已经完成了,再进行一些修饰