Setting/transparency/cartoon/50% 蛋白的透明度 Setting/label/size 18调节字体的大小
Setting/edit all
cartoon的颜色改回白色(在filter里输cartoon可以快点找出来,改完后按回车) //或者输入命令Pymol>set cartoon_color white
在改氢键的线型,在dash gap length width进行调整把虚线改好看点
Stick也可以改细点
13.电子密度
1) 首先,登陆http://eds.bmc.uu.se/eds/搜索你的蛋白
2) download maps
3) 选ccp4格式,generate map
4) 下载后解压,重命名为*.map.ccp4
5) 在pymol里打开,在打开的.map,action/mesh,color/blue
6) 选中lig,在PyMOL输入isomesh map,2j50.map,2.0,sele,carve=1.6