1、 名词：
中心法则：首先由Crick于1958年提出，是遗传信息传递的一般规律，遗传信息可由DNA复制而遗传，由转录、翻译而产生功能产物，信息也可由反转录从RNA进入DNA。
Gene：产生功能性产物（RNA或者蛋白质）所必需的全部DNA序列。
重叠基因：两个或者更多基因使用同一DNA区段作为编码序列，这种形式的基因称为重叠基因。
断裂基因：基因的编码区被非编码序列分隔开来，编码区呈断裂状态，称为断裂基因。
基因重复：在同一个基因组内存在2个或者2个以上拷贝的同源基因序列。 Exon：外显子，DNA 与成熟RNA间的对应区域。
Intron：位于基因编码序列之间，与编码序列同时转录转录，但是在随后加工形成成熟RNA的过程中被去除的序列。 C值：是指真核生物细胞中,单倍细胞核(受精卵或二倍体体细胞中的一半量)里所拥有的DNA含量。
C值反常现象：指一个关于真核生物各物种的基因组大小差异的难题，也就是生物的C值（或基因组大小）并不与生物复杂程度相关的现象。例如植物与原生动物，可能具有比人类更大的基因组。
Genome：基因组，特定生物体单倍体细胞中遗传物质的总和。 2、简述真核生物染色体DNA序列的类型及特征。
答：①不重复序列，每基因组一个或者几个拷贝，多数结构基因存在于此类序列中；②中度重复序列，每基因组10~104拷贝，Alu family、rDNA、tDNA、Histone gene cluster都是中度重复序列；③高度重复序列，一般位于异染色质区，每基因组重复次数＞l05，可作为DNA指纹用于个体鉴别和亲缘关系的确认。 3、简述基因的存在形式。
答：①断裂基因：基因的编码序列是断裂状态，转录后须经剪接形成连续分布的编码序列，主要存在于真核体系，原核体系也有此类基因；
②重叠基因：两个或更多的基因共用同一区段的现象，在小基因组体系如病毒、噬菌体中较为常见，能提高基因组遗传信息的编码能力；
③重复基因：也称为基因重复，是生物进化的动力之一，由于不均等交换、染色体倍增等机制导致基因拷贝数的增加，进而由于突变使得同一个基因组内存在2个或者2个以上拷贝的同源基因序列。
④跳跃基因：即转座子，能在基因组内发生位置移动的序列，可分为DNA转座子、病毒型返座子、肺非病毒型返座子，也是物种形成的因素之一。 ⑤假基因：是与正常基因结构类似但由于突变或者返座等原因不再具备信息表达功能的DNA序列，是DNA进化的遗迹。 6、什么是线性DNA末端短缩问题？
答：DNA聚合酶需要引物提供游离的3’-羟基作为复制起点，而细胞内一般的引物是RNA，在DNA复制完成后会被水解去除。那么在DNA的3’末端由RNA引物引发DNA复制并水解该引物，由于没有额外的羟基帮助DNA聚合酶填补引物去除后的单链区，下一轮复制中DNA将由于末端的不完全复制而出现短缩。 1、名词 切刻（nick）：双链DNA的一条单链出现磷酸二酯键的断裂，称为切刻或者切口。 nick translation：切刻平移，是DNA聚合酶同时行使5’→3’聚合和5’→3’外切功
能，导致双链DNA切刻超3’端移动的现象，可用于DNA的同位素标记。 Klenow 片段：也称为Klenow酶，是DNA聚合酶I经蛋白酶处理后形成的羧基端大片段，具备5’→3’聚合和3’→5’外切活性。
端粒：线性染色体的末端，由一段富含G的正向重复序列（共有序列为TxGy）与相应的端粒结合蛋白共同组成
端粒酶：是一类核糖核蛋白体（ribonucleoprotein ， RNP），实质是自带RNA模板的反转录酶，其模板能与端粒DNA的3'凸出端配对，以端粒DNA的3'-OH起始端粒DNA的延长。
重组：DNA分子间或DNA分子内部的DNA片段的重排或交换。
转座子：是DNA上可自主复制和位移的基本单位。狭义上也专指DNA转座子，直接以DNA的形式在基因组中发生位移的DNA元件。
返座子：是能通过转录形成的RNA进一步反转录后插入到染色体DNA中的一类DNA序列。
2、简述环状DNA复制方式。
答：θ复制：实质是环状DNA的单起点双向复制，每起始一轮复制产生2个拷贝的DNA，以RNA为引物；
滚环复制：也称为共价延伸，环状DNA发生切刻后，由DNA聚合酶以切刻的3’-羟基起始复制并置换5’序列，聚合酶可在环状DNA模板上滚动复制形成共价连接的多拷贝复制产物，其实一次可产生多个拷贝的复制体，引物为DNA的3’-羟基；
D-loop复制：实质是每条DNA链都以单起点单链连续复制的方式进行的DNA复制，其中一条链先起始单链连续复制，产生置换环（displacement loop, D-loop），进而触发另一条链的单链连续复制。
3、请按照复制的阶段，简述原核生物复制各阶段的酶和蛋白质及其功能。 答：①起始：实质是复制起点识别、解链及引物合成的过程
解旋酶：解开双螺旋
SSB：单链结合蛋白，维持DNA的解链状态 拓扑异构酶：消除快速解链造成的正超螺旋 引发酶：合成引物
DNA聚合酶Ⅲ：以引物为起点进行先导链的连续性合成 ②延伸：半不连续复制
解旋酶：在复制叉处解螺旋
SSB：单链结合蛋白，维持DNA的解链状态 拓扑异构酶：消除快速解链造成的正超螺旋 引发酶：每隔一个区段合成一段后随链引物
DNA聚合酶Ⅲ：先导链的连续性合成，利用引发酶产生的引物合成冈崎片段
DNA聚合酶Ⅰ：去除冈崎片段的引物，并聚合dNTP填补缺口 DNA连接酶：连接冈崎片段，形成完整的后随链子链 ③终止：复制体的解体
Tus：识别ter位点，使复制体停顿 拓扑异构酶：解开缠绕的子代DNA
通过DNA修复的方式填补并释放子代dsDNA 5、简述E.coli DNApolIII全酶的结构
答：①催化核心（catalytic core）： 包含1个α亚基 、1个ε 亚基(3'→5'核酸外切酶校正活性)和θ亚基(剌激核酸外切酶)。 ②τ二聚体：连接2个催化核心； ③β夹子（clamp）：结合DNA并使DNApol催化核心把保持持续催化的能力 （通过改变DNA与催化核心的亲和能力）； ④夹钳装载机 (clamp loader)：γ及其余5种蛋白质使具有前进能力的亚基 β 结合到DNA 上。
6、简述大肠杆菌colE1质粒复制的调控机理。
答：实质是通过引物RNA形成的控制来调节colE1质粒的复制。
质粒cilE1复制起始需要RNA引物，该引物是由复制起点上游的一个转录产物（RNA2）在复制起点处切割产生的。
但是该质粒还存在与引物RNA反方向转录的RNA1，与RNA2配对后可导致RNaseH无法切割RNA2产生引物，进而调节colE1质粒的复制。 7、简述大肠杆菌细胞内存在的修复系统及各修复机制的特点。
答：①错配修复系统：修复复制过程中的错配，通过识别DNA上半甲基化的GATC位点实现“修正子链，保存母链”的原则；
②碱基切除修复：识别和去除异常碱基，通过N-糖苷酶识别异常碱基并将其切离产生AP位点（无碱基位点），进一步由AP核酸内切酶切割该位点并替换上正确的碱基。如dUTP的掺入（U-N-糖苷酶系统识别和修正）
③核苷酸切除修复：针对损伤碱基或者嘧啶二聚体，通过识别并切除损伤碱基或者嘧啶二聚体，进而填补缺口。
④重组修复：针对因损伤（如嘧啶二聚体等）使得DNA不能作为复制模板使用的情况。DNA聚合酶III无法识别损伤DNA，出现复制中断，可通过同源重组的方式以同源序列填补缺口，实质上没有对损伤进行修复。也称为复制后修复
⑤跨损伤修复：针对因损伤（如嘧啶二聚体等）使得DNA不能作为复制模板使用的情况。如果此类情况太多将导致复制的失败，此时可采用保真性较差的聚合酶以不依赖于模板的方式聚合dNTP，此类修复变异性较高。
1、名词
引物（Primer）：复制起始时为DNA聚合酶提供游离的3’羟基作为复制起点的物质，体内DNA复制引物一般是RNA，有时也可以DNA或者蛋白质替代。 基因转变：同源重组时由于错配修复而生成非交互性重组链，将一个等位基因转换成另一个等位基因。 基因靶向技术：（gene targeting，又称为基因打靶）将外源DNA导入靶细胞后，利用基因重组，将外源DNA与靶细胞内染色体上同源DNA间进行重组，从而将外源DNA定点整合入靶细胞基因组上某一确定的位点。可用于基因治疗及基因功能的研究。
倒转重复序列（inverted repeat）：即中心对称序列，单链状态下能自身配对。 跨损伤修复（translession repair）：当DNA链在复制过程中遇到损伤而使复制停顿时，机体启动一类不依赖于模板的DNA聚合酶忽略损伤继续复制。通常跨损伤修复是高变异性的，真核生物有专门针对嘧啶二聚体的高保真性跨损伤修复的聚合酶（如DNA聚合酶η）。