Ch15蛋白质代谢(view twice) 1.蛋白质合成--翻译
以mRNA为模板，tRNA为氨基酸运载体，核蛋白体为装配场所，共同协调完成蛋白质装配场所，共同协调完成蛋白质合成过程
2，蛋白质合成已知的三种先进性：（1）蛋白质合成部位核糖体； （2）氨基酸被氨酰-tRNA激活； （3）遗传密码子；
3.遗传密码子：（1）密码子是3个核苷酸编码1个氨基酸； （2）密码子之间没有停顿； （3）起始密码子：AUG;
（4）终止密码子：UAA,UAG,UGA;
4.阅读框：DNA,RNA中邻近的非重复的3核苷酸密码子；一条链上可能有3个阅读框，拥有起始密码子和终止密码子的叫做开放阅读框；
在病毒DNA中，不同阅读框中有重复序列存在；
5.基因密码子特点：连续性；读码不重复；通用性；简并性；摆动性wobble;在密码子与反密码子的配对中，前两对严格遵守碱基配对原则，第三对碱基有一定的自由度，可以“摆动”，因而使某些tRNA可以识别1个以上的密码子。
摆动性让细胞在精确复制要求与速度之间寻求到一种平衡； 6.蛋白质合成
（1）核糖体：rRNA作为一个核糖体蛋白质结合的框架；
细菌核糖体蛋白既作为一个结构成分又作为一个酶成分；
tRNA作为蛋白质合成过程中的转接者，识别所有的密码子需要至少32种tRNA；
tRNA二维结构：三叶草形；三级结构：倒L型； mRNA作为翻译的模板；
（2）过程：?氨基酸的激活，两种化学要求：每个氨基酸的羧基基团必须被激活；
在每个新氨基酸和其对应mRNA遗传信息上建立联系；
氨酰-tRNA合成酶将正确的氨基酸连接到它的tRNA上去；每种酶对应一个氨基酸；氨酰tRNA合成酶识别每个tRNA上独特的位点； 氨酰-tRNA和mRNA被称为第二遗传密码； ?启动：特定的氨基酸启动蛋白质的合成；
细胞如何区分启动蛋氨酸密码子和内源蛋氨酸密码子？甲硫氨酸使用两种tRNA:细菌,线粒体，叶绿体中用tRNAfMet识别起始蛋氨酸密码子； 真核细胞中用特殊的tRNAMet启动（内源位置的AUG密码子启动）；
单个的密码子AUG是如何既编码tRNAfMet和tRNAMet的？启动的编码AUG核糖体被mRNA中的SD序列移动到正确位置上；
细菌核糖体有3个氨酰-tRNA结合位点：A,P,E；其中tRNAfMet是唯一一个以从P位点结合开始的tRNA;
?延长：（1）结合新来的tRNA;（在这一步中有校对，检查密码子和其反密码子是否结合正确）
（2）肽键形成； （3）移位；
④终止和释放：（1）多肽链合成的终止需要一个信号（释放信号RF)
（2）在细菌中，转录和翻译同时进行；真核生物中，转录完成出核才能进行翻译；
⑤折叠和转录后加工：折叠成正确的三维构象；
折叠前后肽链进行酶加工：氨基端，羧基端修饰；信号序列缺失；蛋白酶水解；寡糖添加；对于特定氨基酸的修饰；辅基添加；二硫键形成； 7.蛋白质合成被很多抗生素，毒素所抑制 （1）四环素：阻碍A位点； （2）氯霉素：阻碍肽转移；
（3）链霉素：抑制起始，密码子错读； 8.蛋白质转运与降解
（1）细胞内蛋白命运：溶酶体，膜蛋白，分泌蛋白； 线粒体，叶绿体，核蛋白； 胞浆蛋白；
（2）真核生物蛋白质修饰从ER中开始，通过氨基端信号序列进入ER; （3）信号序列普遍特点：疏水氨基酸组成；
在疏水序列之前的一个或多个靠近氨基端带正电氨基酸残基； 氨基端附近邻近断裂点附近的氨基酸呈极性，为短侧链氨基酸残基；
（4）蛋白质糖基化对于蛋白质定位关键：许多蛋白在ER被糖基化，在N端天冬酰胺残基上链上寡糖链；
继而在高尔基体中O-糖基化被加上，N-端糖基化被继续修饰；
（5）蛋白质分选是基于蛋白质的结构而不是信号序列；
（6）运进线粒体，叶绿体的蛋白质要和细胞质伴护蛋白结合如Hsp70，去折叠进入后再折叠；
（7）运进核中的蛋白信号序列（核蛋白定位序列NLS)不被切掉； (8) 细菌也通过信号序列转运蛋白质；
（9）细胞运进蛋白通过受体介导的内吞作用；
（10）降解系统：ATP依赖的胞质系统，真核原核都适用；（泛素化ubiquitin） 溶酶体系统，仅适用于真核生物；