第三章
1、蛋白质定义：
蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。 蛋白质（protein）是生命的物质基础，是有机大分子，是构成细胞的基本有机物，是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。氨基酸是蛋白质的基本组成单位。它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质占人体重量的16%~20%，即一个60kg重的成年人其体内约有蛋白质9.6~12kg。人体内蛋白质的种类很多，性质、功能各异，但都是由20多种氨基酸（Amino acid）按不同比例组合而成的，并在体内不断进行代谢与更新。
2、一级结构（primary structure)：氨基酸残基在蛋白质肽链中的排列顺序称为蛋白质的一级结构，每种蛋白质都有唯一而确切的氨基酸序列。 蛋白质的一级结构包括：
（1）组成蛋白质的多肽链的数目； （2）多肽链的氨基酸顺序；
（3）多肽链内或链间二硫键的数目和位置。
3、二级结构（secondary structure）：蛋白质分子中肽链并非直链状，而是按一定的规律卷曲（如α-螺旋结构）或折叠（如β-折叠结构）形成特定的空间结构，这是蛋白质的二级结构。蛋白质的二级结构主要依靠肽链中氨基酸残基亚氨基（—NH—）上的氢原子和羰基上的氧原子之间形成的氢键而实现的。
4、蛋白质的等电点：由于蛋白质表面离子化侧链的存在，蛋白质带净电荷。由于这些侧链都是可以滴定的（titratable），对于每个蛋白都存在一个pH使它的表面净电荷为零即等电点。 英文缩写：pI。
蛋白质在溶液中有两性电离现象。假设某一溶液中含有一种蛋白质。当pI=pH时该蛋白质极性基团解离的正负离子数相等，净电荷为0，此时的该溶液的是pH值是该蛋白质的pI值。某一蛋白质的pI大小是特定的，与该蛋白质结构有关，而与环境pH无关。
在某一pH溶液中当pH>pI时该蛋白质带负电荷，反之pH 5、蛋白质变性的影响因素： 变性的因素: 物理因素: 高温，紫外线，X射线，超声波，剧烈震荡等( 任两个均可)。 化学因素: 强酸，强碱，尿素，去污剂，重金属，三氯醋酸等。 盐析作用：盐析(salting out)是指在蛋白质水溶液中加入中性盐，随着盐浓度增大而使蛋白质沉淀出来的现象。中性盐是强电解质，溶解度又大，在蛋白质溶液中，一方面与蛋白质争夺水分子，破坏蛋白质胶体颗粒表面的水膜；另一方面又大量中和蛋白质颗粒上的电荷，从而使水中蛋白质颗粒积聚而沉淀析出。常用的中性盐有硫酸铵、氯化钠、硫酸钠等，但以硫酸 铵为最多。得到的蛋白质一般不失活，一定条件下又可重新溶解，故这种沉淀蛋白质的方法在分离、浓缩，贮存、纯化蛋白质的工作中应用极广。 第四章 1.酶的定义 定义:活细胞合成的具有催化功能的生物大分子(绝大多数是蛋白质) 功能:作为生物催化剂,摧化生物体内所有化学反应。是物质代谢必不可少的. 本质:蛋白质(绝大多数-----蛋白质在生命活动中的重要体现)、核酸（核酶） 2米氏方程 Vm[S] V= Km+[S] Vm Vm[S] 2 = Km+[S] Km+[S] = 2 Vm[S]/ Vm Km = 2[S]- [S] =[S] V=1/2Vm Km（米氏常数）是酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度 表示酶与底物亲和力。两者成反比。 Km值越大，酶与底物亲和力越小。 Km值是酶的特征性常数,与酶的结构、底物和反应环境有关，与酶的浓度无关 米氏方程是描述底物浓度与反应速度的关系式。V=Vmax[S]/(Km+[S])。其中Km为米氏常数，Vmax为最大反应速度，它们都是酶的特征常数，Km能表征酶和底物的亲和力。测定一种酶的Km和Vmax常采用双倒数作图法，即设置一系列底物浓度，并测定对应的反应速度，再使用1/V和1/[S]作图，回归获得直线方程，计算出Km和Vmax. 影响酶高催化效率的因素及机理。 (一)邻近与定向效应 是指酶受底物诱导发生构象变化，使底物与酶的活性中心楔合，对于双分子反应来说，两个底物能集中在酶活性中心，彼此靠近并有一定的取向。这样就大大提高了活性部位上底物的有效浓度，使一个分子间的反应变成了-一个近似于分子内的反应，从而增加了反应速度。 (二)底物分子敏感键扭曲变形 酶活性中心的结构有-种可适应性，当专- -性底物与活性中心结合时，可以诱导酶分子构象的变化，使反应所需要的酶中的催化基团与结合基团正确的排列和定位，使催化基团能够合适地处在被作用的键的地方，与此同时，变化的酶分子又使底物分子的敏感键产生“张力”，甚至“变形”，从而促进酶底物络合物进入过渡态，降低了反应活化能，加速了酶促反应。实际上这是酶与底物诱导契合的动态过程。酶活性中心的某些基团，在底物的分步反应中，经常表现为酸碱催化与共价催化的作用。 （3）酸碱催化 广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子或通过质子碱接收部分质子的作用达到降低活化能的过程 (4)共价催化 它是指酶活性中心处的极性基团，在催化底物发生反应的过程中，首先以共价键与底物结合生成一个活性很高的共价型的中间产物，反应所需的活化能大大降低，反应速度明显加快。 金属离子参与的催化被称为金属催化:①作为路易斯酸(Lewis acid)接受电子，使亲核基团或亲核分子(如水)的亲核性更强;②电荷屏蔽作用，与带负电荷的底物结合，屏蔽负电荷，促进底物在反应中正确定向;③ 电子传递中间体 许多氧化还原，每种都含有铜离子和铁离子，他们作为酶的辅助因子，起着传递电子的功能 (6)多功能催化作用。 酶的活性中心部位，一般都含有多个起催化作用的基团,这些基团在空间有特殊的排列和取向，可以对底物价键的形变和极化及调整底物基团的位置等起到协同作用，从而使底物达到最佳反应状态。 (7)活性部位的疏水微环境。 化学基团的反应活性和反应速率受反应介质的影响。非极性环境中两个带电荷基团之间的静电相互作用要比极性环境中强得多。酶的活性部位往往是疏水环境，当底物进入酶的活性部位时,底物周围的水化层被脱去，从而大大增加了酶催化的效率 4酶的专一性 酶对所作用的底物有严格的选择性。一种酶仅能作用于一种物质，或一类分子结构相似的物质，促其进行一定的化学反应，产生一定的反应产物，这种选择性作用称为酶的专一性。 结构专一性包含1绝对专一性，2结构专一性又包含键专一性，基团专一性 立体异构专一性 5核酶 核酶(ribozyme)一词用于描述具有催化活性的RNA, 即化学本质是核糖核酸(RNA), 却具有酶的催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子, 有些作用底物就是同一RNA分子中的某些部位。核酶的功能很多,有的能够切割RNA, 有的能够切割DNA, 有些还具有RNA 连接酶、磷酸酶等活性。与蛋白质酶相比，核酶的催化效率较低，是一种较为原始的催化酶。 核酶（ribozyme）是具有催化功能的RNA分子。核酶又称核酸类酶、酶RNA、类酶RNA。 6酶最适PH值 酶活性受其反应环境的PH影响，且不同的酶对PH有不同要求，酶活性最大的某一PH值为酶的最适PH值，如胃蛋白酶的最适PH约为1.8，肝精氨酸酶最适PH为9.8，但多数酶的最适PH接近中性。 最适PH不是酶的特征性常数，它受底物浓度、缓冲液的种类与浓度、以及酶的纯度等因素影响。 第五章 核酸的定义（名词解释）: 是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物，为生命的最基本物质之一。 核酸的组成及其在细胞内的分布（简答）: 核酸基本单位是核苷酸有含氮碱基五碳糖磷酸三种小分子物质组成 核酸分为DNA（脱氧核糖核酸）RNA（核糖核酸） DNA主要分布在细胞核中此外线粒体 叶绿体也含有少量DNA,原核细胞的DNA位于拟核 RNA主要分布在细胞质中