生产企业免抵退申报的一般步骤：
新办企业安装申报系统后，首先应进行系统维护，一般企业申报流程： 第一步明细数据采集； 第二步免抵退税预申报； 第三步预审反馈疑点调整； 第四步模拟出具进料加工免税证明； 第五步纳税申报；
第六步纳税申报表数据采集； 第七步免抵退汇总表数据采集； 第八步免抵退正式申报。
新用户或对相关业务不是很熟悉可通过“申报系统操作向导”逐步完成当月退税申报。 （一）系统维护
初次运行系统，需以系统管理员身份sa(小写)进入系统，不要输入密码。 首先进行系统维护，系统维护是出口退税申报系统的基础工作，对于新安装申报系统的用户首先应进行系统维护，之后才能进行出口业务的录入申报。 新安装用户进入系统必须进行系统初始化、系统配置设置与修改、系统口令设置与修改三个菜单操作。 1、系统初始化
系统初始化是在系统第一次使用时或在特定条件下需要清空所有数据记录时，可选择此项操作，清除标准代码表以外的所有实用数据。由于该项操作涉及到
系统的全部实用数据，所以只有管理员有此操作权限，其他用户没有此操作权限。
2、系统配置设置与修改。是将出口企业的相关信息，企业代码、纳税人识别号、用户名称、纳税人类别、计税计算方法等内容录入系统，进料加工计算方法选“2”购进扣税法，不按月计算退税的新办出口企业计税方法为选“4”免抵，按月计算免抵退税的企业计税方法为选“1”免抵退，分类管理代码选“C”。
3、系统参数设置与修改，设置系统备份路径(建议备份到有E盘或其他盘)、网络数据路径、申报地址等申报报参数。
4、系统口令设置与修改。该菜单可以增加新的操作人和修改、删除原操作人及口令。增加新用户必须以管理员身分（sa）进入系统，用户名：进入系统时要求输入的用户名，可以是英文字母或数字、汉字、最长为8个字符。操作人姓名：录入对应操作人的真实姓名；操作人级别，0为系统管理员，1为主管负责人，2为一般操作人。日常操作中用要求以一般用户身分登录。用户口令设置：以“管理员身份”进入该模块后，可以看到所有用户，也可以添加修改用户资料，一般用户只能对口令进行修改。
5、数据优化。在系统运行过程中由于停电和其他非正常原因引起申报系统出错，可执行此功能重新建立各种数据库索引。
6、系统备份。用户应定期对系统进行备份，备份默认路径C：\\退税申报系统备份，备份路径可以更改，系统不能备份在安装目录下。
7、系统数据导入。当系统出现数据丢失或损坏的时候，通过选择“系统数据导入”可恢复到上次备份的数据。 （二）基础数据采集 录入有关项目说明：
所属期，由4位年份码加2位月份码构成； 序号，4位流水号按月编； 记销售日期：记出口销售帐日期
所属期标识：默认出口销售记帐日期，按出口离岸年份填列。
进料登记册号：属于进料加工业务的填写进料加工海关登记册号码，属于一般
贸易的些栏为空。 原币汇率，100外币兑换人民币汇率； 美元汇率，100美元兑换人民币汇率；
单证不齐标志：缺报关单填B，缺核销单填H，缺代理证明填D，缺报关单、缺核销单与缺代理证明不能同时填列。 录入时根据右下方数据项目说明填写。
出口企业应根据进料加登记手册、报关单、核销单、出口发票、代理证明等单据资料进行明细录入。
1、进料加工手册登记录入：出口企业应按进料加工手册号，根据经外经贸主管部门签发的《加工贸易业务批准证》，将进料加工有关数据录入申报系统中。 2、进口料件明细申报：出口企业应按财务制度规定将本月进口的料件及时入帐，并根据进口报关单等资料将进口情况录入该模块，录入时系统自动检测进料加工手册是否登记，若已登记可录入其他字段，否则无法继续录入操作。 3、进料加工手册核销录入：企业须在进料加工手册最后一笔出口业务发生之后，海关缴销手册之前办理有关核销手续，录入核销信息后，申报系统对整本手册的相关数据进行重新计算，出具手册核销后的证明，调整“免抵退税额抵减额”和“不予免征和抵扣税额抵减额”。