原核微生物（prokaryotic microbe）：指核质和细胞质之间不存在明显核膜，其染色体由单一核酸组成的一类微生物。
原核细胞型微生物（procaryotic cell microbe）：指没有真正细胞核（即核质和细胞质之间没有明显核膜）的细胞型微生物。
真核细胞型微生物（eukaryotic cell microbe）：指具有真正细胞核（即核质和细胞质之间存在明显核膜）的细胞型微生物。
真菌（fungi）：有真正细胞核，没有叶绿素的生物，它们一般都能进行有性和无性繁殖，能产生孢子，它们的营养体通常是丝状的且有分枝结构，具有甲壳质和纤维质的细胞壁，并且常常是进行吸收营养的生物。 霉菌（Mold）：具有丝状结构特征的真菌。 细菌（bacterium）：单或多细胞的微小原核生物。
病毒（virus）：是一类没有细胞结构但有遗传复制等生命特征，主要由核酸和蛋白质组成的大分子生物。是比细菌更小的专性细胞内寄生的微生物，大多数能通过细菌过滤器。
放线菌（actionomycetes）：一目形成真的菌丝成分枝丝状体的细菌。 蓝细菌（cyanobacterium）：是光合微生物，蓝细菌是能进行光合作用的原核微生物。
原生生物（protistan）：指比较简单的具有真核的生物。 原生动物（protozoa）：单细胞的原生生物。
免疫学（immunology）：研究利用预防接种法治疗疾病的科学。
立克次氏体（Richettsia）：节肢动物专性细胞内寄生物，它的许多类型对人和其它动物是致病的微生物。
感染（Infection）：宿主由于微生物生长的病理学状况。
巴氏灭菌法（pasteurization）：亦称低温消毒法，冷杀菌法，利用较低的温度既可杀死病菌又能保持物品中营养物质风味不变的消毒法。
巴斯德消毒法（Pasteurization）：在一控制温度给液体食物或饮料加热以提高保藏质量，同时也消毀有害的微生物。
化学疗法（chemotherapy）：用化学药物来治疗传染病。 化学治疗（Chemotherapy）：用化学制品治疗疾病。
抗生素疗法（tetracycline）：用真菌等生物产生的抗生素来治疗疾病。 分类学（Tasonomy）：尽可能有亲缘关系基础上对有机体的分类。 无性繁殖系（Clone）：从单一细胞传下来的细胞集群。 属（Genus）：一组亲缘关系非常接近的种。
分辨率（resolving power）：能够分辨出两者之间最小的距离。 菌株（Strain）：单一分离体后代组成的微生物纯培养物。
污染：微生物纯培养物和灭过菌的物品等被某些杂菌或有害微生物混人或沾染的现象。
螺旋状细菌（Spirillum）：螺旋状的或开塞钻状的细菌。（呈弯曲状的细菌） 螺旋体（Spirochete）：螺旋形细菌；多为寄生性的。 链球菌（Streptococci）：分裂后细胞成链的球菌。 弧菌：菌体呈有一个弯曲呈弧形（即弯度一圈）。 螺菌：菌体较为坚硬有多个弯曲。
衰老型、退化型：细菌在老的培养物中会出现各种与正常形状不一样的个体，重新培养有些可以恢复，有些不可以恢复原来的形状。
细菌多型性：有些细菌尽管在最适宜的（正常的）环境中生长，其形态也很不一致。
菌柄（Prosthecas）：在诸如柄杆菌属的细菌中，作为细胞壁的一部分的附器。 球状体（球形体，spheroplast）：多用革兰氏阴性细菌，以溶菌酶法处理获得，其外壁的结构尚存，所以，原生质体对外界环境具一定抗性，并能在普通培养基上生长的细菌菌体。
细菌细胞壁（cell-wall）：包在表面较坚韧略具有弹性的结构，是一层较薄的膜状结构。
核（Nucleus）：细胞内结构，含有染色体。
细胞膜（cell membrance）：是细胞壁和原生质之间一层柔软并具有半透性的生物膜（又叫质膜、原生质膜、胞浆膜）。
革兰氏染色法（Gram stain）：一种鉴别染色法，当用脱色剂处理时，根据保留或失去原始着色剂（结晶紫）与否，细菌被划分为革兰氏阳性或革兰氏阴性。 核蛋白（Nucleoprotein）：由核酸和蛋白质组成的复合物分子。组蛋白：存在于真核细胞内的一类碱性蛋白（其作用之一是使大量遗传信息压缩在核内） 质粒：细菌除了原核以外，还有染色体外遗传因子（为环状DNA分子，能自我复制）
荚膜（Capsule）：围绕某些微生物细胞壁的一种胶状包被或粘液层。（细菌细胞壁外的一层较松厚，而且较固定的粘液性物质）。
粘液层：细菌细胞壁外的一层较松厚，而且较固定的没有明显的边缘粘液性物质。 菌胶团：如果细菌荚膜连在一起，其中包含有许多细菌叫菌胶团。
细菌的化学趋避运动：细菌趋势向吸引物并聚集于浓度区或与避离排斥物，菌体集中在低浓度区，蛋白质为接受物。
细菌的光趋避运动：先培养在具有弱光的液体培养基中，用强光照射某一区域，通过10—100分钟，通过鞭毛运动，集中在强光照射区。
鞭毛（Flagellum）：细胞上柔软的鞭状的附器（细长的原生质突起），作为一种运动器官。一端单毛菌：菌体一端只有一条鞭毛。
二端单毛菌：菌体二端各有一条鞭毛。
丛毛菌：菌体一端成二端各有一丛鞭毛（偏端丛生鞭毛菌、二端丛生鞭毛菌）； 周毛的（Peritichous）：围绕细胞整个表面长着鞭毛。
周毛菌（Peritichous flagellum bacterium）：在菌体四周都有鞭毛。
伞毛（Fimbriae）：某些革兰氏阴性细菌的表面附器，由蛋白质亚单位构成，直径大约为7nm。它们比鞭毛短些、细些。也叫做纤毛。
线毛（Pili，散毛，纤毛，菌毛）：比鞭毛更细，较短，直硬，数量也较多的细丝。
核蛋白体（核糖体）：细胞质中无胞膜的颗粒结构，直径150-200埃。 中间体（中体）：包围质的膜折皱陷入到质细胞里的结构。
异染颗粒：用染料多色美兰染色，菌体部分兰色颗粒红紫色，故称异染颗粒。 脂类颗粒：细菌在代谢过程中积累起来，但不能被细菌作养料脂类颗粒。 多糖颗粒：有糖原和淀粉二类颗粒，可作为细菌的能量来源。 液泡（Vacuole）：细胞质内清晰的空间。
芽孢（内生孢子Endospora）：某些细菌生长到一定阶段，有细胞内形成一个圆形成圆柱形的对不良环境条件具有较强的抵抗力休眠体叫之。
孢囊（cytocyst）：由营养细胞缩短变成球菌，表面形成一层厚的孔壁称之。 伴孢晶体（parasporal crystal）：某些芽孢杆菌，如苏云金杆菌，在细胞内产生一种晶体状多肽类内含物称之。
裂殖生殖（Schixoteny）：营养体多重分裂的无性生殖。
裂殖（schizogenesis）：表现为细胞的横分裂称为裂殖。异形裂殖：裂殖后形成子细胞与母细胞大小不相等，称为异形裂殖。
同形裂殖：裂殖后形成子细胞与母细胞大小相等，称为同形裂殖。 裂殖体（Schizont）：疟疾寄生物无性生活周期的一个阶段。
菌落（集落bacterial colony）：固体培养基上肉眼可见的微生物生长物（微生物的单个个体或孢子在固体培养基上生长繁殖后形成肉眼可见的集团） 菌苔（bacterial lawn）：几个菌落连在一起成片生长。
培养基（media）：是人工配制的适合于不同微生物生长繁殖或者积累代谢产物的营养基质。
基内菌丝（营养菌丝，substrate mycelium），长在培养基内的放线菌菌丝。菌丝无分隔，可以产生各种水溶性、脂肪性色素，使培养基着色。
气生菌丝（二级菌丝）：由基内营养菌丝长出培养基外伸向空间的放线菌菌丝。气生菌丝直生或分枝丝状，较基内菌丝粗。
孢子丝（sporotrichial）：当生长发育到一定阶段，在其气生菌丝上分化出可形成孢子的放线菌菌丝。