生物信息学课后习题及答案
（由10级生技一、二班课代表整理）
一、绪论
1.你认为，什么是生物信息学？
采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋
白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。
2.你认为生物信息学有什么用？对你的生活、研究有影响吗？ （1）主要用于：
在基因组分析方面：生物序列相似性比较及其数据库搜索、基因预测、基因组进化和分 子进化、蛋白质结构预测等
在医药方面：新药物设计、基因芯片疾病快速诊断、流行病学研究：SARS、人类基因组计划、基因组计划：基因芯片。
（2）指导研究和实验方案，减少操作性实验的量；验证实验结果；为实验结果提供更多的支持数据等材料。
3.人类基因组计划与生物信息学有什么关系？ 人类基因组计划的实施，促进了测序技术的迅猛发展，从而使实验数据和可利用信息急剧增加，信息的管理和分析成为基因组计划的一项重要的工作 。而这些数据信息的管理、分析、解释和使用促使了生物信息学的产生和迅速发展。
4简述人类基因组研究计划的历程。
通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其他生物进行类似研究。
1990，人类基因组计划正式启动。
1996，完成人类基因组计划的遗传作图，启动模式生物基因组计划。
1998完成人类基因组计划的物理作图，开始人类基因组的大规模测序。Celera公司加入，与公共领域竞争启动水稻基因组计划。
1999，第五届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度。 2000，Celera公司宣布完成果蝇基因组测序，国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基因组的测序工作。
2001，人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。
2003，中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的.目标全部实现。 2004，人类基因组完成图公布。
2.我国自主知识产权的主要基因组测序计划有哪些？ 水稻（2002），家鸡（2004），家蚕（2007），家猪（2012），大熊猫（2010）
二．第一章
1、生物信息指哪些？
主要有从DNA序列、蛋白质序列、蛋白质结构和功能研究中解读的：遗传信息、进化信息、结构和功能信息。
2、基因组测序的基本策略有哪些？
逐个克隆法：小片段针对图谱的！！ 全基因组鸟枪法：大片段-测序-组装
3.什么叫contig?
Contig：重叠群，基因组测序中将许多序列片段经过比对找到重叠区,从而连接成的长片段。
4、生物信息学中最重要的贡献是什么？
1970: Needleman和Wunsch提出了著名的序列比对算法，是生物信息学发展中最重要的贡献；
5、什么事件大大促进了生物信息学的发展？ 20世纪90年代后
HGP促进生物信息学的迅速发展
6、生物信息学研究有什么意义？
（1）认识生物本质，了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系
（2）改变生物学的研究方式
（3）改变传统研究方式，引进现代信息学方法 （4）在医学上的重要意义
为疾病的诊断和治疗提供依据 为设计新药提供依据
三．第二章 1、简述三干六界学说。
2.TSS,外显子和内含子的概念。
TSS是转录起始位点（Transcription Start Site）的英文缩写，是指DNA上一段与RNA聚合酶结合并起始转录的一段DNA序列。真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。其中的编码区即为外显子，非编码区即为内含子。
3. 如何判断起始密码子？内含子？
AUG甲硫氨酸（met） 内含子（5’-GT??AG-3’）
4.蛋白质二级结构有哪些？ （1）螺旋
（2）b折叠 – 平行折叠 反平行折叠
（3）b转角 – 连接作用”U”型结构（大多Phe, Gly组成）
（4）无规卷曲-没有确定规律性的肽链构象，但仍是紧密有序的稳定结构 （5）无序结构 多肽链中有60％的区段为a螺旋和b折叠
5、HGP选择作为研究人类的四大“模式生物“有哪些？
酵母、线虫、果蝇、小鼠。
6、背诵生物信息数据库中的核苷酸代码？
核苷酸A（腺嘌呤）C（胞嘧啶）G（鸟嘌呤）T（胸腺嘧啶）非A非C非G非T代码ACGTBDHV核苷酸U（尿嘧啶）C或T（U）G或T（U）A或T（U）A或GA或CG或CA或C或G或T（U）代码UYKWRMSN
四．第三章（1）
1、下列数据库分别是什么类型的数据库？
序列数据库中的核酸数据库（GenBank PIR DDBJ SWISS-PROT EMBL） 结构数据库（PDB）