机制,结合对各部门预算执行情况的考核,制定相应的配套奖惩措施,对积极增收节支、预算执行情况良好、资金效益高的部门给予一定的奖励。对浪费资金、预算超支、预算执行情况不好、资金使用效益低下的部门处以一定的惩罚,这样可以维护预算的严肃性和有效性,避免虚报项目,盲目争取资金不办事现象,充分调动各部门预算管理的积极性,使财务预算管理工作进入科学化、制度化、规范化的轨道。
二、我国行政事业单位预算管理中存在的主要问题： （一）预算编制周期设臵不科学
目前,我国正在推行的部门预算采取了“两上两下,上下结合”的编制程序。这比以前由上级部门代编预算或以指标代预算的做法已经一个很大的进步。但与国外相对规范的预算编制程序相比,我们还存在着预算编制准备期偏短,预算执行期限与预算通过法定审批程序的时间不一致的问题。
现阶段部门预算编制的时间十分仓促，以2010年部门预算时间安排为例，从财政部6月上旬发布通知到7月底截止报送，时间不足2个月，各部门再经过层层布臵、下达，留给基层预算单位编制预算的时间一般不到半个月，造成预算编制过于粗放，难以科学合理地预计来年经费需求。
另外，年度预算经费下达得较晚，导致部门预算执行出现“真空期”。以海事部门预算为例，每年预算批复要待预算年度的4或5月份及以后才下达到各部门。由于这段时间各级预算执行没
有正式下达，造成部门预算获得批准并开始执行的时间远远滞后于预算编制，这导致许多单位无法及时开展工作，大部分的项目的执行集中到下半年，年中执行率极低，出现年底突击花钱的现象，这不仅影响了年度预算执行工作的正常进行，也极大地削弱了部门预算作为法律性文件的严肃性和约束力。
（二）财务部门“单打独斗”，缺乏职能部门的协调性。 在预算编制上，“钱多好办事”、“重投入、轻效益”的传统观念仍然比较突出，不少人认为预算主要是财务部门的事情，尤其是有些项目负责人认为自己主要搞好项目的技术工作就行了，对预算工作既不熟悉也不特别重视。这种没有领导支持和职能部门协调配合，单靠财务部门冥思苦想编制出来的经费预算，往往编制得草率、粗糙、且缺乏科学性。在预算执行方面，财务部门和业务部门又彼此缺少有效的沟通，财务人员不了解项目的进度，技术管理人员不了解预算执行情况，导致预算执行随意无序，失去严肃性。
（三）预算编制缺乏科学性，编制内容不够全面
首先是基本支出的人员经费明显偏低。由于财政部对人员经费控制过严，对许多部门的人员经费的核定脱离了各单位职工人数增长、职工收入增长的实际。从理论上讲，承担财政项目的各事业单位工作人员的工资是国家财政拨付的，但实际上单位人员工资缺口很大，往往通过职工福利基金或事业基金进行弥补。
在基本支出的公用经费预算编制上，有的部门在申请下年公共经费的预算时，不去认真研究来年的任务需求，为保证经费的充足，尽量多报预备财务部门或领导削减，而由于财务部门不掌握预算数的计算依据，往往是依据上年决算书在增加一定比例上报，导致的结果是批复的基础支出公用经费预算数并不能反映单位的实际需求。
项目支出预算则不够细化，缺乏科学的论证，不少项目因不具备实施条件而延误，或因未办妥地方规划、消防等行政部门的许可和审批而更改，造成财政支出进度总体偏慢，财政资金效益难以充分发挥。
(四)没有形成切实有效的绩效评价考核机制
目前，行政事业单位的支出，尤其是项目支出种类繁杂、数目众多。因此在实践中，许多项目支出的绩效评价，仅仅依靠财政部门是难以完成的，有的需要权威机构或专家的参与才能实现。在支出管理上与监督考核方面缺乏强有力的控制与行之有效的约束机制和激励机制。同时经费使用的社会效益如何，也缺乏系统考核机制，继而增加了经费使用的随意性。
三、我国行政事业单位预算管理的实践探索及理论思考 学习国外预算管理体制的特点，根本目的是借鉴其先进的预算管理理念和管理方法，努力完善我国预算管理体制，提高管理水平。就目前来说，我们至少应当从以下几个方面入手，逐步建立起有中国特色的预算管理体系：
（一）编制中长期预算，提高预算的前瞻性
部门预算要包括上年执行情况，并且编制以后五年中期预算，以利于比较分析。但审议时只批准年度预算，五年收支规划作为参考。通过科学准确的预测中期经济发展和财政收入趋势，可提供了中长期的预算前景，提高了预算的前瞻性和年度预算安排的均衡性，减少了测算的盲目性，提高预算执行率。
（二）科学分解预算，实现预算管理的精细化
对预算实行精细管理，分解到每个经济分类科目，并将预算指标纳入年度考核目标，签订财务管理目标责任书。在预算安排上，本着一盘棋的原则统筹安排，优先保障人员经费和业务工作经费和纳入年度工作目标的专项工作经费。对容易失控的科目或需要控制的开支比如业务招待费、会议费的预算实行刚性约束，未经批准调整预算，不得超支，也不得从其他开支结余中调剂，其他开支可以在总预算内调剂，但也有一定的比例限制，不得无节制地增长。通过精细的预算控制，我们能够较好地控制全局的支出情况，基本上从年初的预算安排就可以预知年终的决算情况，通过实行精细化管理确保预算管理工作上新台阶
（三）尽早编制预算，按时下达预算批复
建议财政部在部门预算不断规范、细化的基础上，还应进一步提前编制预算，给予各部门至少一个月的时间进行预算编制，并尽量在年初下达预算批复。在每年年初人大会议审议通过当年预算之后，马上进入下年度预算的编制工作。这样各单位可以提