的一切都会被彻底摧毁。
Neo：放屁！
*其他救世主的回应显现在监视器上：放屁！
设计师：否认是所有人类反应中最容易预知的一种。但不可否认的是，这将是我们第六次摧毁Zion，我们干得越来越干净利落。
*电影画面切换到崔妮蒂和密探的对打，然后又回到建造者的房间。*
设计师：救世主的作用就是现在要返回源极(the source，本源)，散播你所携带的编码，重新植入源程序。然后你要从 Matrix 中选出 16 个女性，7 个男性共 23 个人类个体来重建锡安。如果没有按照这个步骤来进行，将会导致灾难性的系统崩溃，这会杀死连接在 Matrix 上的所有人附带的锡安毁灭，这也意味着全人类的绝灭。
Neo：你不会让这样的事情发生的，你不会的。你们（//机器）需要人类才能生存。 设计师：我们已经作好了接受任何幸存程度的准备。但与此相关的问题是你是否已经准备好为这个世界所有人类的灭亡承担责任？
*设计师按下他拿在手里的笔上的一个按键，Matrix 里各个地方的人的图像显现在监视器里。
设计师：观察你的反应很有趣。你的五个前辈都是在一个相同推断的基础上设计以便你执行我们设计好的流程，这个可能的巧合意味着与你们种类的附属关系. 其他的那些救世主们是按常规的方式经历这一过程的，相对他们, 你的经历却是相当特殊的, 你经历着爱.
*Neo梦里崔妮蒂和密探大战的画面出现在监视器上。* Neo：崔妮蒂！
设计师：顺带说一句，她进入 Matrix 牺牲她自己是为了救你。 Neo：不！
设计师: 这最终让我们来到揭示真相的时刻. 基本缺陷出现时, 偏差表现为开始和结束. 这里有两道门. 你右边的门是通往源极拯救锡安的. 你左边的门是回到 Matrix, 去往她以及你们种类绝灭的. 就像你说的, 问题的关键是选择. 可是我们已经知道你准备如何选择了, 不是吗? 我已经能够看到由此产生的连锁反应, 你体内的前体生化物质发出的信号引起情感的开始, 压制了你的逻辑和理智. 你的情感已经蒙蔽了一个简单而明显的事实——她就快要死了，而你却无可奈何。
*Neo走向他左边的门*
设计师：哼。希望，最典型的人类错觉。它既是你们最强大的力量又是你们最大的弱点。 Neo：如果我是你，我希望我们不会再见面。 设计师：我们不会再见面的。
尼奥和设计师的这段对话可以说深奥之极，能听一遍就懂得人恐怕不多，我也是在反复琢磨之后才终于明白设计师到底告诉尼奥些什么，首先，我们得出一个振聋发聩的结论，锡安也是假的，也是设计师设计的一个 Matrix 而已，莫非斯他们并没有得到真正的自由，他们仍然活在 Matrix 中而并不自知。人类自他们出生的时候，Matrix 分配每个人一个角色. 99% 的人接受这个角色，让这个角色控制他们的大脑。所以与其说这些人是人，还不如说他们只有一个附着在生命体上的一段意识而已，这段意识被 Matrix 所左右。他们没有自主的意识，取而代之控制大脑的是由 Matrix 编写的具有人类意识特征的程序，由于这些人愿意接受分配给他们任何角色，所以他们可以被特工控制思想，被 Smith 复制。另外 1％ 的人他们自主的潜意识如此的强（Neo,莫菲斯,崔妮蒂，等），他们不愿接受 Matrix 分配给的角色，并且能隐约感到有些地方不对劲，开始思考自身存在的方式，这种对 Matrix 分配过来的角色不兼容性，如果不进行控制会导致系统的不稳定和崩溃。因此编写 Matrix 的设计师，编写了一套不同于 Matrix 的另一个系统模拟程序，为了诉说的方便我把他称之为
Matrix2，并给那些自主意识很强的人编写了另外的角色，这些人指的就是片中莫非斯,崔尼悌等叛军。设计师编写 Matrix2 （其实这个创意是先知--Matrix 之母想出来的）的目的有两个，一个是让这些不安分的人有一个区别于大多数安分的人的不同的生存空间，他们是不稳定因素，这样就可以把这些不稳定因素从 Matrix 中剔除，保证 Matrix 的稳定；另一个就是 Matrix2 也是一个研究程序，用来研究这些不安分的人的行为，就像人类研究那些特别不安分的猴子一样，掌握他们的特性，从而更有效的控制他们。还有一个设计师没有明说的目的，我觉得也是显而易见，莫非斯这些人不断地去寻找、解救 Matrix中那些不安分的人类，等于是从某种程度上在帮助 Matrix 净化环境，省了很多设计师的力气。那么，尼奥又是怎么回事情？在这里，我想引用网上一段很知名也很经典的一段论述来说明尼奥是何许人：Who am I? 这是在第一集里 Neo 苦苦追寻答案的问题。Why am I here? 这是 Neo 在第二集追寻的问题。我们随着电影的进度，也在苦苦思索着答案。如上面所说的那样，Neo即是 program, 又是人。但他是很特殊的人，很特殊的 program. 我们在这里应该把 The one 和 Neo分开。The one 指 pogram(//救世主相当于一段恢复程序，可以重建锡安的程序), Neo 指附载 The one 的人的身体。
①先从 program 角度说。The one 不是由 Matrix 编写的program. 也不是由编写 Matrix 的 Architect（AI机器)编写，他是由更上一层即编写Architect的人（//指真实的人——设计师也不是人，他是AI机器，他也是程序，是被人编写出来的——程序创建了MATRIX）编写的或者具有这一层的代码。因而他在 Zion 和 Matrix 都有超能力即破坏系统的运行规则。编写 The one 这 program 的目的是为了完善 Matrix, 从而让机器能永远控制人类。在 zion 中的那些 program 因为允许部分人类的意识存在，并且人类意识在不断的加强，到了一定时间人类的意识会超越 program, 导致这部分人苏醒，这是机器所不允许的，所以在这个时刻来临之前，zion 必须被消灭。但是在 zion 这些 program 已有更好
表达人类自主意识的代码，这些代码对完善Matrix是非常重要的。The one 的作用就象影片中 Arichetect 对 Neo 的谈话中提到的：你的生命是 Matrix 固有程序中一个失衡因式的残留总和。你是一个偏差的偶然性，是尽管我竭尽全力，仍不能消除的影响数学精度和谐的一个偏差。尽管它不断地制造麻烦让我小心翼翼地处理它，但它并不是不可预测的，它仍然处于控制范围之内。它引导着你来到这里。正如我上面所说，The one 是一个特殊的 program，它有伪装的code，它开始没有能意识它自己核心的 code. 因而才有片中死后重生的过程。在第一集开始的时候，Neo 是由最外层由 Matrix 编写的角色 program 控制，Morpheus 等在 oracle 的引导下，找到 Neo, upgrade Neo到第二层 code（即与Morpheus等相同的代码）, Neo 在第一集死掉的时候，这层代码消失，释放出 The one 的核心code. 使 Neo 意识到自己的超能力。这部分 code 早已存在，只不过现在才起作用，控制了 Neo 的大脑。这一次的再生，可以说使 Program 的苏醒，并不是人的自主意识的苏醒。所以这时候 Neo 可以叫做 The one 的 program.
②再从人的角度来说 neo, 作为程序的生物载体，他的人类的自主意识在一，二集里还并没有苏醒，仍然由 program 控制，只不过是不同 program 控制。但 Neo 是不同于一般人的躯体，也许他身上有最初编写 Architect 的人的遗传基因。他潜在人类自主意识很强，所以他才能接受 The one 这 program. 并同时影响 The one 这 program. 所以在 1，2 集里他都在对自己真实身份不断进行思索。当他面对 Architect 的时候，他的人类意识已经苏醒了很多，虽然还没有控制大脑。但当面对有可能导致全人类灭亡的选择的时候，前 5 任 Neo(The one) 的人类意识退缩（这种对人类的爱正如 Architect 所说即是人的最强的地方，也最弱的弱点），让 The one 这 program 完成它的任务，回到 Matrix 的 source, 升级Matrix, 从而苏醒的人类意识再度消失。之后 The one 按照程序设定的选择 23人重建 Zion, 新的循环开始。而第六任 Neo 出现不同，他经历和 Trinity 的爱(这是程序安排好的，
为研究人类的情感，所以 oracle 告诉 Trinity 她会爱上 The one)，而这个爱超越前五任对 Trinity 的爱，人类潜在的意识使他选择重回 Matrix, 去救Trinity. 这是机器没想到的，The one 的 program 也没有这代码。这也意味着 neo 的人类意识开始超越 The one 这 program, 所以再回到Zion 后，他感觉到了新的变化，并能再zion中使用超能力。
我对上面的论述基本表示同意，尼奥其实是 The One 6.0 版本，但是我们要注意到设计师一开始的一句话“虽然整个过程改变了你的意识，但你依然是不折不扣的人类”，尼奥确实是有着生物属性的人类，这跟先知、法国人他们不同，这就注定了尼奥在第三集里面的能力必然还会提升，他太与众不同，在第二集结尾的时候，尼奥用空手杀死了四个八爪鱼就已经在预示着第三集中尼奥的超能力，这同时也很有力的证明了锡安只是 Matrix2 的结论。在尼奥杀死4个八爪鱼之后，尼奥昏迷。 如果说第一集只是让我看到了一个很精彩的故事的话，那么随着第二集那个振聋发聩的结论的得出，我已经开始感到我不仅仅是在看电影，有点像在看一个哲学故事了，想起了庄周梦蝶，庄子不知道是自己做梦变成蝴蝶了还是蝴蝶作梦变成了自己。锡安也是假的，可怜的莫非斯他们从一个梦中醒来又跌进了第二个梦，他们还是在梦中，那么到底什么是真实，或许正像第一集里面莫非斯向刚被解救的尼奥解释什么是 Matrix 一样，什么是真实？真实就是我们看到的、听到的、摸到的，归根到底就是大脑皮层的反应，那么既然理论是这样，我们又何必管他我们有没有真正的躯体，只要能看能听能动，我们不就是真实的吗？
第一集的故事主线很明确，人物也很简单，就是叛军和特工，多的没了。但是到了第二集，整个剧情得到了极大的扩展，千头万绪，众多人物向观众们倾泻而下，Smith ，先知，保镖，法国人，双胞胎，开锁人，设计师，每一个人物似乎都充满了谜。我甚至开始为沃卓斯基兄弟担忧了，场面已经搞大了，这第三集将如何收场？剧情该如何走向？网上讨论的热烈也开始趋向白热化，各种猜测都接踵而至，我注意到一种有趣的现象，讨论最热烈的以程