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简?/p>

&

安装

 

Pymol

是一个开放源码,由使用者赞助的分子三维结构显示软件,由

Warren 

Lyford DeLano

编写,并且由

DeLano Scientific LLC

负责商业发行?/p>

 

Pymol

被用来创作高品质的分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构。据?/p>

件作者宣称,

在所有正式发表的科学论文中的蛋白质结构图像中?/p>

有四分之一?/p>

使用

Pymol

来制作的?/p>

 

Pymol

名字的来源:“Py”表示该软件基于

python

这个计算机语言,“Mol”则

是英文分子(

molucule

)的缩写,表示该软件用来显示分子结构?/p>

 

由于实验需要,

本人正在学习该软件,

在这里把学习过程记录下来?/p>

希望对有需

要的朋友有所帮助。今天先来说说安装吧?/p>

 

?/p>

2006

?/p>

8

?/p>

1

日起?/p>

DeLano 

Scientific 

对事先编译好?/p>

PyMOL

执行程序

(包

?/p>

beta

版)采取限定下载的措施。目前,只有付费用户可以取得。不过源代码

目前还是可以免费下载,供使用者编译。如果你和我一样,不想为此花钱的话?/p>

  

1.

 

如果你是

Windows

用户,首先下?/p>

Pymol

的源代码?/p>

 

然后安装

CygWin

,并且确保正确安装以下模块:

  

?/p>

 

C++ (gcc or g++ package name)  

?/p>

 

Python  

?/p>

 

OpenGL  

?/p>

 

PNG  

然后在源代码目录里面依次运行?/p>

  

2.

 

如果你是

Linux

用户,首先确保以下东东已安装?/p>

  

?/p>

 

Python  

?/p>

 

Pmw  

?/p>

 

OpenGL driver

(我用的?/p>

NVdia

?/p>

  

?/p>

 

libpng  

?/p>

 

Subversion client

(下载源代码需要)

  

然后下载

Pymol

的源代码

 

$ mkdir pymol-src 

$ 

svn 

co 

https://pymol.svn.sourceforge.net/svnroot/pymol/trunk/pymol 

pymol-src 

然后进入源代码目?/p>

 

# cd pymol-src 

开始依次编?/p>

 

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是一个开放源码,由使用者赞助的分子三维结构显示软件,由

Warren 

Lyford DeLano

编写,并且由

DeLano Scientific LLC

负责商业发行?/p>

 

Pymol

被用来创作高品质的分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构。据?/p>

件作者宣称,

在所有正式发表的科学论文中的蛋白质结构图像中?/p>

有四分之一?/p>

使用

Pymol

来制作的?/p>

 

Pymol

名字的来源:“Py”表示该软件基于

python

这个计算机语言,“Mol”则

是英文分子(

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)的缩写,表示该软件用来显示分子结构?/p>

 

由于实验需要,

本人正在学习该软件,

在这里把学习过程记录下来?/p>

希望对有需

要的朋友有所帮助。今天先来说说安装吧?/p>

 

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版)采取限定下载的措施。目前,只有付费用户可以取得。不过源代码

目前还是可以免费下载,供使用者编译。如果你和我一样,不想为此花钱的话?/p>

  

1.

 

如果你是

Windows

用户,首先下?/p>

Pymol

的源代码?/p>

 

然后安装

CygWin

,并且确保正确安装以下模块:

  

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C++ (gcc or g++ package name)  

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Python  

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OpenGL  

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然后在源代码目录里面依次运行?/p>

  

2.

 

如果你是

Linux

用户,首先确保以下东东已安装?/p>

  

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Python  

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Pmw  

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OpenGL driver

(我用的?/p>

NVdia

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Subversion client

(下载源代码需要)

  

然后下载

Pymol

的源代码

 

$ mkdir pymol-src 

$ 

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https://pymol.svn.sourceforge.net/svnroot/pymol/trunk/pymol 

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然后进入源代码目?/p>

 

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Pymol

是一个开放源码,由使用者赞助的分子三维结构显示软件,由

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编写,并且由

DeLano Scientific LLC

负责商业发行?/p>

 

Pymol

被用来创作高品质的分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构。据?/p>

件作者宣称,

在所有正式发表的科学论文中的蛋白质结构图像中?/p>

有四分之一?/p>

使用

Pymol

来制作的?/p>

 

Pymol

名字的来源:“Py”表示该软件基于

python

这个计算机语言,“Mol”则

是英文分子(

molucule

)的缩写,表示该软件用来显示分子结构?/p>

 

由于实验需要,

本人正在学习该软件,

在这里把学习过程记录下来?/p>

希望对有需

要的朋友有所帮助。今天先来说说安装吧?/p>

 

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目前还是可以免费下载,供使用者编译。如果你和我一样,不想为此花钱的话?/p>

  

1.

 

如果你是

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用户,首先下?/p>

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的源代码?/p>

 

然后安装

CygWin

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C++ (gcc or g++ package name)  

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Python  

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然后在源代码目录里面依次运行?/p>

  

2.

 

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然后下载

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的源代码

 

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https://pymol.svn.sourceforge.net/svnroot/pymol/trunk/pymol 

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是一个开放源码,由使用者赞助的分子三维结构显示软件,由

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编写,并且由

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Pymol

被用来创作高品质的分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构。据?/p>

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名字的来源:“Py”表示该软件基于

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如果你是

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然后安装

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C++ (gcc or g++ package name)  

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2.

 

如果你是

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(下载源代码需要)

  

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