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立方水体中泛素的分子动力学模拟及热容计算

 

姓名:程永新

   

通过对立方水体中泛素的分子动力学模拟,初步认识学习了分子动力学模

拟软?/p>

NAMD

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MD

的使用及结果分析。下面报告里主要介绍学习模拟的过程及

其遇到的问题?/p>

 

一?/p>

VMD

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NAMD  

1.

软件简?/p>

 

NAMD

是动力学拟合的主体软件,但它不同于我们所熟悉的大多数

Windows

软件:它不具有图形界面。由于进行动力学模拟的准备和结果的可视化分析?/p>

必不可少的软件是

VMD

,下面的讲解中也将大量用?/p>

VMD

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2.

软件安装

 

VMD

安装简单,可以再随意的目录下?/p>

NAMD

不需要直接安装,而是需要下

?/p>

NAMD tutorial

压缩包,并将

NAMD

软件包解压缩?/p>

NAMD tutorial

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这里

说的

NAMD tutorial

不是一个软件使用指导文本,而是有很多子文件夹的压缩

包?/p>

 

 

 

 

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立方水体中泛素的分子动力学模拟及热容计算

 

姓名:程永新

   

通过对立方水体中泛素的分子动力学模拟,初步认识学习了分子动力学模

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是动力学拟合的主体软件,但它不同于我们所熟悉的大多数

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软件:它不具有图形界面。由于进行动力学模拟的准备和结果的可视化分析?/p>

必不可少的软件是

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2.

软件安装

 

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安装简单,可以再随意的目录下?/p>

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立方水体中泛素的分子动力学模拟及热容计算

 

姓名:程永新

   

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NAMD ubiqutin simulation - 百度文库
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立方水体中泛素的分子动力学模拟及热容计算

 

姓名:程永新

   

通过对立方水体中泛素的分子动力学模拟,初步认识学习了分子动力学模

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