AFLP
技术的基本原理与实验方?/p>
AFLP
技术的基本原理
:
AFLP
技术是一项新的分子标记技术,
其原理是?/p>
基因?/p>
DNA
经过二种酶不同的限制性内切酶酶切后,
产生?/p>
性末端,
再使用连接酶将人工合成的双链接头连接在酶切位点的粘性末端?/p>
接头一端具有与内切酶同样的识别?/p>
性末端,互补连接后成?/p>
DNA
模板进行预扩增。接头和与接头相邻的酶切片断的几个碱基序列作为引物的结合?/p>
点。引物由
3
部分组成
:
①核心碱基序列,该碱基序列与人工接头互补;②特异性酶切序列;③引?/p>
3
’端选择?/p>
碱基?/p>
选择性碱基延伸到酶切片段区,
这样就只有那些两端序列能与选择碱基配对的限制性酶切片段被扩增?/p>
?/p>
外,
通过选择在末端分别添加了
1
?/p>
3
个选择性核苷酸的不同引物,
可以达到选择扩增的目的?/p>
这些选择性核苷酸
使得引物选择性地识别具有特异配对序列的内切酶酶切片段。并与之结合,实现特异性扩增?/p>
实验方法
:
(1)
DNA
酶切
AFLP
技术成功的关键在于
DNA
的充分酶?/p>
,
所以对模板质量要求较高
,
?/p>
DNA
完全溶解后利用紫外分光光度仪
测定
DNA
浓度,将
DNA
浓度用双蒸水调整?/p>
50ng/ul,
应避免其?/p>
DNA
污染和抑制物质的存在?/p>
?/p>
1
?/p>
E-M
酶切体系
反应体系?/p>
E-M
?/p>
合)
1/2
?/p>
1
?/p>
DNA
?/p>
50ng/ul
?/p>
1.50ul
3.0 ul
EcoR
?/p>
(10u/ ul)
0.25ul
0.5 ul
Mse
?/p>
(10u/ ul)
0.15ul
0.3 ul
Tango
Buffer (10
×
)
2.50ul
5.0 ul
ddH
2
O
8.10ul
16.2
ul
总体?/p>
12.5ul
25 ul
?/p>
2
?/p>
P-M
酶切体系
反应体系?/p>
P-M
?/p>
合)
1/2
?/p>
1
?/p>
DNA
?/p>
50ng/ul
?/p>
1.50ul
3.0 ul
Pst
?/p>
(10u/ ul)
0.25ul
0.5 ul
Mse
?/p>
(10u/ ul)
0.15ul
0.3 ul
Buffer R (10
×
)
1.25ul
2.5 ul
ddH
2
O
9.35ul
18.7
ul
总体?/p>
12.5ul
25 ul