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EMSA

实验技术及方法简?

实验简?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率实验

?/p>

EMSA-electrophoretic mobility shift assay

?/p>

是一种研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最

初用于研?/p>

DNA

结合蛋白?/p>

目前已用于研?/p>

RNA

结合蛋白和特定的

RNA

序列的相互作用?/p>

 

通常将纯化的蛋白和细胞粗提液?/p>

32P

同位素标记的

DNA

?/p>

RNA

探针一同保温,在非?/p>

性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针?/p>

DNA-

复合物或

RNA-

复合物比非结

合的探针移动得慢?/p>

同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,

可是双链或者是单链?/p>

?/p>

检?/p>

 

如转录调控因子一类的

DNA

结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽

提液。在检?/p>

RNA

结合蛋白时,依据目的

RNA

结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的

蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的

DNA

?/p>

RNA

片段

和寡核苷酸片段(特异?/p>

?/p>

 

和其它非相关的片段(非特异)

,来确定

DNA

?/p>

RNA

结合蛋白

的特异性?/p>

在竞争的特异和非特异片段的存在下?/p>

依据复合物的特点和强度来确定特异结合?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率检?/p>

?/p>

Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA

?/p>

是一种检测蛋

白质?/p>

DNA

序列相互结合的技术,

最初用于研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列

相互作用?/p>

可用于定性和定量分析?/p>

这一技?/p>

 

目前已用于研?/p>

RNA

结合蛋白和特定的

RNA

序列的相互作用?/p>

 

 

 

 

 

由于很多研究?/p>

TF

不具有结合的特异性,所以即使发?/p>

TF

和被研究的寡核苷酸探?/p>

结合,也不表示在体内?/p>

TF

不能和其它寡核苷酸结合,运用一些生物信息学

 

软件,可?/p>

模拟表示

TF

与基因启动子区寡核苷酸结合的具体情况?/p>

发现

TF

可以和启动子?/p>

PUTATIVE 

结合?/p>

 

 

同时,由?/p>

EMSA

在体外不能模

 

拟细胞内众多生物分子的相互作用,比如,某一

TF

在细胞内由于受到其它

TF

的协同或者修饰后才能与寡核苷酸结合的话,

那么在体外是不能

重现这一结果的?/p>

 

 

2003 

年上一篇关?/p>

ChIP

方法的介绍文献攻?/p>

EMSA 

没有考虑细胞内完整自然的染色

质结构和调节的影响而受到很大的限制?/p>

 

下面是在一?/p>

PROTOCAL

 

1.

探针的标记:

 

 

(1) 

如下设置探针标记的反应体系:

 

 

待标记探?/p>

 

(1.75pmol/

微升

) 2

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1

微升

 

 

Nuclease-Free Water 5

微升

 

 

[γ

-32P]A

TP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml) 1

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase (5-10u/

微升

) 1

微升

 

 

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实验技术及方法简?

实验简?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率实验

?/p>

EMSA-electrophoretic mobility shift assay

?/p>

是一种研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最

初用于研?/p>

DNA

结合蛋白?/p>

目前已用于研?/p>

RNA

结合蛋白和特定的

RNA

序列的相互作用?/p>

 

通常将纯化的蛋白和细胞粗提液?/p>

32P

同位素标记的

DNA

?/p>

RNA

探针一同保温,在非?/p>

性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针?/p>

DNA-

复合物或

RNA-

复合物比非结

合的探针移动得慢?/p>

同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,

可是双链或者是单链?/p>

?/p>

检?/p>

 

如转录调控因子一类的

DNA

结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽

提液。在检?/p>

RNA

结合蛋白时,依据目的

RNA

结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的

蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的

DNA

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RNA

片段

和寡核苷酸片段(特异?/p>

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和其它非相关的片段(非特异)

,来确定

DNA

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结合蛋白

的特异性?/p>

在竞争的特异和非特异片段的存在下?/p>

依据复合物的特点和强度来确定特异结合?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率检?/p>

?/p>

Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA

?/p>

是一种检测蛋

白质?/p>

DNA

序列相互结合的技术,

最初用于研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列

相互作用?/p>

可用于定性和定量分析?/p>

这一技?/p>

 

目前已用于研?/p>

RNA

结合蛋白和特定的

RNA

序列的相互作用?/p>

 

 

 

 

 

由于很多研究?/p>

TF

不具有结合的特异性,所以即使发?/p>

TF

和被研究的寡核苷酸探?/p>

结合,也不表示在体内?/p>

TF

不能和其它寡核苷酸结合,运用一些生物信息学

 

软件,可?/p>

模拟表示

TF

与基因启动子区寡核苷酸结合的具体情况?/p>

发现

TF

可以和启动子?/p>

PUTATIVE 

结合?/p>

 

 

同时,由?/p>

EMSA

在体外不能模

 

拟细胞内众多生物分子的相互作用,比如,某一

TF

在细胞内由于受到其它

TF

的协同或者修饰后才能与寡核苷酸结合的话,

那么在体外是不能

重现这一结果的?/p>

 

 

2003 

年上一篇关?/p>

ChIP

方法的介绍文献攻?/p>

EMSA 

没有考虑细胞内完整自然的染色

质结构和调节的影响而受到很大的限制?/p>

 

下面是在一?/p>

PROTOCAL

 

1.

探针的标记:

 

 

(1) 

如下设置探针标记的反应体系:

 

 

待标记探?/p>

 

(1.75pmol/

微升

) 2

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1

微升

 

 

Nuclease-Free Water 5

微升

 

 

[γ

-32P]A

TP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml) 1

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase (5-10u/

微升

) 1

微升

 

 

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凝胶迁移或电泳迁移率实验

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EMSA-electrophoretic mobility shift assay

?/p>

是一种研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最

初用于研?/p>

DNA

结合蛋白?/p>

目前已用于研?/p>

RNA

结合蛋白和特定的

RNA

序列的相互作用?/p>

 

通常将纯化的蛋白和细胞粗提液?/p>

32P

同位素标记的

DNA

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RNA

探针一同保温,在非?/p>

性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针?/p>

DNA-

复合物或

RNA-

复合物比非结

合的探针移动得慢?/p>

同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,

可是双链或者是单链?/p>

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检?/p>

 

如转录调控因子一类的

DNA

结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽

提液。在检?/p>

RNA

结合蛋白时,依据目的

RNA

结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的

蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的

DNA

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RNA

片段

和寡核苷酸片段(特异?/p>

?/p>

 

和其它非相关的片段(非特异)

,来确定

DNA

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结合蛋白

的特异性?/p>

在竞争的特异和非特异片段的存在下?/p>

依据复合物的特点和强度来确定特异结合?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率检?/p>

?/p>

Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA

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是一种检测蛋

白质?/p>

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序列相互结合的技术,

最初用于研?/p>

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结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列

相互作用?/p>

可用于定性和定量分析?/p>

这一技?/p>

 

目前已用于研?/p>

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结合蛋白和特定的

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序列的相互作用?/p>

 

 

 

 

 

由于很多研究?/p>

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不具有结合的特异性,所以即使发?/p>

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和被研究的寡核苷酸探?/p>

结合,也不表示在体内?/p>

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软件,可?/p>

模拟表示

TF

与基因启动子区寡核苷酸结合的具体情况?/p>

发现

TF

可以和启动子?/p>

PUTATIVE 

结合?/p>

 

 

同时,由?/p>

EMSA

在体外不能模

 

拟细胞内众多生物分子的相互作用,比如,某一

TF

在细胞内由于受到其它

TF

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那么在体外是不能

重现这一结果的?/p>

 

 

2003 

年上一篇关?/p>

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没有考虑细胞内完整自然的染色

质结构和调节的影响而受到很大的限制?/p>

 

下面是在一?/p>

PROTOCAL

 

1.

探针的标记:

 

 

(1) 

如下设置探针标记的反应体系:

 

 

待标记探?/p>

 

(1.75pmol/

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) 2

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T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1

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Nuclease-Free Water 5

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[γ

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TP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml) 1

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T4 Polynucleotide Kinase (5-10u/

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) 1

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EMSA原理简?- 百度文库
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实验简?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率实验

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EMSA-electrophoretic mobility shift assay

?/p>

是一种研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最

初用于研?/p>

DNA

结合蛋白?/p>

目前已用于研?/p>

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结合蛋白和特定的

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序列的相互作用?/p>

 

通常将纯化的蛋白和细胞粗提液?/p>

32P

同位素标记的

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探针一同保温,在非?/p>

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DNA-

复合物或

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同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,

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如转录调控因子一类的

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结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽

提液。在检?/p>

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结合蛋白时,依据目的

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结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的

蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的

DNA

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和寡核苷酸片段(特异?/p>

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和其它非相关的片段(非特异)

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DNA

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结合蛋白

的特异性?/p>

在竞争的特异和非特异片段的存在下?/p>

依据复合物的特点和强度来确定特异结合?/p>

 

凝胶迁移或电泳迁移率检?/p>

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Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA

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白质?/p>

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序列相互结合的技术,

最初用于研?/p>

DNA

结合蛋白和其相关?/p>

DNA

结合序列

相互作用?/p>

可用于定性和定量分析?/p>

这一技?/p>

 

目前已用于研?/p>

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结合蛋白和特定的

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序列的相互作用?/p>

 

 

 

 

 

由于很多研究?/p>

TF

不具有结合的特异性,所以即使发?/p>

TF

和被研究的寡核苷酸探?/p>

结合,也不表示在体内?/p>

TF

不能和其它寡核苷酸结合,运用一些生物信息学

 

软件,可?/p>

模拟表示

TF

与基因启动子区寡核苷酸结合的具体情况?/p>

发现

TF

可以和启动子?/p>

PUTATIVE 

结合?/p>

 

 

同时,由?/p>

EMSA

在体外不能模

 

拟细胞内众多生物分子的相互作用,比如,某一

TF

在细胞内由于受到其它

TF

的协同或者修饰后才能与寡核苷酸结合的话,

那么在体外是不能

重现这一结果的?/p>

 

 

2003 

年上一篇关?/p>

ChIP

方法的介绍文献攻?/p>

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没有考虑细胞内完整自然的染色

质结构和调节的影响而受到很大的限制?/p>

 

下面是在一?/p>

PROTOCAL

 

1.

探针的标记:

 

 

(1) 

如下设置探针标记的反应体系:

 

 

待标记探?/p>

 

(1.75pmol/

微升

) 2

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1

微升

 

 

Nuclease-Free Water 5

微升

 

 

[γ

-32P]A

TP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml) 1

微升

 

 

T4 Polynucleotide Kinase (5-10u/

微升

) 1

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