phylip浣跨敤璇存槑 - 鐧惧害鏂囧簱

鏂板缓

涓婁紶

棣栭〉

鍔╂墜

鏈�杩?/div>

璧勬枡搴?/div>

宸ュ叿

 

绯荤粺鍙戣偛鏍戠殑甯哥敤绠楁硶

 

1.UPGMA (PHYLIP: neighbour)

闄ゆ潈閰嶅�规�?/p>

 

2.Neighbour Joining (PHYLIP: neighbour)

涓磋繎璺濈�绘�?/p>

 

3.Fitch-Margoliash (PHYLIP: fitch) 

4.Maximum Parsimony 

鏈�澶х畝绾︽�ф硶

 

DNA sequences (PHYLIP: dnapars) 

Protein sequences (PHYLIP: protpars) 

5.Maximum Likelihood 

鏈�澶у彲鑳芥�ф硶

 

DNA sequences (PHYLIP: fastDNAML, Molphy: nucML) 

Protein sequences (Molphy: protML) 

鏋勫缓杩涘寲鏍戠殑瀹屾暣姝ラ��

 

鈶?/p>

 

瀵规墍鍒嗘瀽鐨勫�氬簭鍒楃洰鏍囪繘琛屾帓鍒楋�?/p>

do alignment

锛?/p>

銆?/p>

 

鈶?/p>

 

鏋勫缓涓�涓�杩涘寲鏍戯�?/p>

To reconstrut phyligenetic tree

锛?/p>

銆?/p>